277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1226 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
637 aa  1254    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  51.94 
 
 
640 aa  526  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  44.92 
 
 
647 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  42.11 
 
 
638 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  40.47 
 
 
631 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  43.08 
 
 
629 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  39.12 
 
 
683 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  37.88 
 
 
631 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  39.78 
 
 
652 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  37.52 
 
 
645 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  38.8 
 
 
695 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  36.96 
 
 
682 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  38.23 
 
 
645 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  38.23 
 
 
645 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  38 
 
 
681 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  36.56 
 
 
683 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  38.54 
 
 
642 aa  360  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  39.05 
 
 
660 aa  356  7.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  36.51 
 
 
624 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  36.51 
 
 
624 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  36.15 
 
 
682 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  35.63 
 
 
688 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  37.77 
 
 
685 aa  346  8.999999999999999e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  35.02 
 
 
641 aa  343  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  35.81 
 
 
657 aa  342  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.97 
 
 
676 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  35.12 
 
 
680 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  34.91 
 
 
626 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  35.03 
 
 
681 aa  333  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  35.56 
 
 
649 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  35.56 
 
 
649 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  34.69 
 
 
680 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  34.43 
 
 
667 aa  327  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
667 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
667 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
667 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
714 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
667 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  34.28 
 
 
667 aa  325  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  34.64 
 
 
657 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  34.25 
 
 
686 aa  318  3e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  34.44 
 
 
686 aa  316  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  34.6 
 
 
640 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  33.99 
 
 
657 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  35.76 
 
 
640 aa  310  4e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  33.63 
 
 
659 aa  298  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  32.93 
 
 
660 aa  296  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  31.96 
 
 
640 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  33.96 
 
 
568 aa  293  7e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  33.43 
 
 
644 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  31.76 
 
 
643 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  31.76 
 
 
643 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  31.76 
 
 
643 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  33.79 
 
 
641 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  40.22 
 
 
541 aa  278  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
641 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
672 aa  277  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  33.08 
 
 
641 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  32.88 
 
 
641 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  32.11 
 
 
641 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  32.98 
 
 
641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  31.67 
 
 
642 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  32.26 
 
 
641 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  32.09 
 
 
691 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  35.05 
 
 
653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  32.99 
 
 
665 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  31.15 
 
 
638 aa  273  6e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  32.38 
 
 
638 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
665 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  36.19 
 
 
920 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  31.23 
 
 
639 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  29.72 
 
 
665 aa  267  4e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  31.18 
 
 
638 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  32.98 
 
 
642 aa  262  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
553 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
553 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
553 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
553 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  37.5 
 
 
553 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  37.25 
 
 
549 aa  259  8e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  27.58 
 
 
709 aa  257  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  29.33 
 
 
680 aa  254  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 
646 aa  254  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  34.58 
 
 
546 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  34.73 
 
 
547 aa  251  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 
658 aa  250  5e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  36.45 
 
 
539 aa  249  7e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  34.51 
 
 
547 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.93 
 
 
658 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
547 aa  248  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  34.51 
 
 
547 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
637 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  34.29 
 
 
547 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  34.29 
 
 
547 aa  246  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  35.51 
 
 
554 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  34.07 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>