234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2436 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
586 aa  1203    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  32.44 
 
 
532 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.87 
 
 
583 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  37.77 
 
 
541 aa  179  9e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  32.27 
 
 
531 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.65 
 
 
486 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  38.1 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  36.86 
 
 
838 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  35.03 
 
 
570 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  31.75 
 
 
858 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  36.36 
 
 
471 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  33.91 
 
 
637 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  37.66 
 
 
480 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  35.36 
 
 
489 aa  148  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
708 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  34.14 
 
 
430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  33.75 
 
 
858 aa  147  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.75 
 
 
858 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  34.32 
 
 
525 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 
623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
818 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
846 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
627 aa  127  8.000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
847 aa  126  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.06 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  34.07 
 
 
647 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 
463 aa  122  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  32.31 
 
 
920 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  31.51 
 
 
637 aa  120  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.28 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  29.87 
 
 
630 aa  118  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 
478 aa  118  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  34.22 
 
 
519 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  29.82 
 
 
696 aa  115  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 
682 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
613 aa  113  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 
481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  31.95 
 
 
463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  30.51 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 
683 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.29 
 
 
546 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  33.8 
 
 
642 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 
640 aa  107  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.42 
 
 
695 aa  107  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.96 
 
 
653 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 
652 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  23.65 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  23.65 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  23.65 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  23.65 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 
681 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  23.65 
 
 
547 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  23.48 
 
 
547 aa  104  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31.42 
 
 
645 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  23.48 
 
 
547 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
697 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 
645 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.49 
 
 
645 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
640 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  23.48 
 
 
547 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  23.48 
 
 
547 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  30.88 
 
 
698 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 
702 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 
628 aa  99.4  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.05 
 
 
644 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  29.1 
 
 
680 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.62 
 
 
459 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
624 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 
631 aa  98.2  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
624 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  25.06 
 
 
454 aa  98.2  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
620 aa  97.4  7e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
680 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 
464 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 
638 aa  96.3  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 
715 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
685 aa  95.9  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  30.97 
 
 
568 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 
456 aa  94.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 
560 aa  95.1  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 
686 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  31.48 
 
 
1363 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 
649 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  31.48 
 
 
1363 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 
649 aa  93.6  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
475 aa  93.6  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 
683 aa  93.2  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  29.03 
 
 
642 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.47 
 
 
629 aa  92  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 
686 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
682 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 
482 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
640 aa  90.1  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
681 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
642 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 
631 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 
688 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
691 aa  88.2  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>