253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3705 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  82.35 
 
 		 642 aa  981    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 645 aa  1254    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 645 aa  1254    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  70.72 
 
 		 641 aa  859    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  43.21 
 
 		 645 aa  476  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  45.27 
 
 		 629 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  41.85 
 
 		 652 aa  446  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  40.58 
 
 		 638 aa  427  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  41.58 
 
 		 631 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  41.24 
 
 		 657 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  38.81 
 
 		 683 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  38.58 
 
 		 631 aa  392  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  41.6 
 
 		 657 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  36.63 
 
 		 647 aa  382  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  41.6 
 
 		 657 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  40.39 
 
 		 659 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  38.24 
 
 		 637 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  40.27 
 
 		 667 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 714 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  40.42 
 
 		 667 aa  369  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  40.56 
 
 		 667 aa  365  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 643 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 643 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 643 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  40.6 
 
 		 665 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  40.45 
 
 		 665 aa  340  4e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  35.21 
 
 		 644 aa  339  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  38.83 
 
 		 660 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  34.16 
 
 		 682 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  34.79 
 
 		 680 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  32.85 
 
 		 695 aa  323  4e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  34.36 
 
 		 680 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  35.48 
 
 		 681 aa  320  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.9 
 
 		 681 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.67 
 
 		 676 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  34.74 
 
 		 624 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  34.74 
 
 		 624 aa  311  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  34.25 
 
 		 640 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  33.38 
 
 		 686 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  34.01 
 
 		 686 aa  300  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  33.58 
 
 		 640 aa  299  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  33.85 
 
 		 626 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  35.01 
 
 		 642 aa  298  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  35.29 
 
 		 653 aa  295  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.24 
 
 		 683 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  32.03 
 
 		 682 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  32.89 
 
 		 672 aa  288  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  31.94 
 
 		 691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 		 638 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  34.01 
 
 		 640 aa  278  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 		 658 aa  274  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 688 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  29.26 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  31.77 
 
 		 642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  33.23 
 
 		 660 aa  263  6.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  37.67 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  32.33 
 
 		 641 aa  262  2e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  30.88 
 
 		 638 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  32.18 
 
 		 641 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  35.54 
 
 		 548 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 		 641 aa  259  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 641 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  32.52 
 
 		 642 aa  257  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  36.68 
 
 		 539 aa  256  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  31.3 
 
 		 639 aa  251  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  30.32 
 
 		 640 aa  250  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  31.16 
 
 		 641 aa  249  9e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 641 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  31 
 
 		 641 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  31.16 
 
 		 641 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  35.6 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 		 637 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  35.6 
 
 		 547 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  35.6 
 
 		 547 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  35.6 
 
 		 547 aa  243  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  34.31 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  35.38 
 
 		 547 aa  241  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  35.6 
 
 		 547 aa  242  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  34.31 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  34.31 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  35.38 
 
 		 547 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  36.41 
 
 		 541 aa  240  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  35.16 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  35.16 
 
 		 547 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  30.49 
 
 		 665 aa  237  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 646 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  35.85 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  35.85 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  35.85 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  35.85 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  35.85 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  27.48 
 
 		 626 aa  228  4e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.11 
 
 		 658 aa  227  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 		 637 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 624 aa  226  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>