268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3152 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  100 
 
 
696 aa  1422    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  49.36 
 
 
697 aa  640    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  56.49 
 
 
702 aa  814    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  52.34 
 
 
698 aa  735    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  44.83 
 
 
715 aa  596  1e-169  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  38.24 
 
 
690 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  34.14 
 
 
647 aa  141  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
858 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
478 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.52 
 
 
477 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 
456 aa  130  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  29.43 
 
 
541 aa  128  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.69 
 
 
680 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 
568 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.9 
 
 
680 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  31.76 
 
 
465 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  31.31 
 
 
628 aa  125  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.66 
 
 
920 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  29.8 
 
 
532 aa  125  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
588 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
477 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
480 aa  124  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 
583 aa  124  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 
645 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.9 
 
 
525 aa  122  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  33.6 
 
 
458 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.6 
 
 
682 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 
686 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 
676 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.97 
 
 
653 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 
645 aa  120  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  28.8 
 
 
838 aa  120  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
613 aa  120  9e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 
617 aa  120  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  32.27 
 
 
463 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  29.9 
 
 
686 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
629 aa  118  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 
681 aa  118  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 
489 aa  119  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 
642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  30.2 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  30.4 
 
 
640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
649 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  29.82 
 
 
586 aa  115  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
652 aa  115  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  29.08 
 
 
623 aa  115  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
541 aa  114  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.6 
 
 
486 aa  114  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
649 aa  114  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
681 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 
627 aa  113  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 
614 aa  112  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 
531 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 
683 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.33 
 
 
631 aa  111  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 
695 aa  111  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  27.09 
 
 
637 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
464 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
637 aa  110  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
691 aa  110  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
672 aa  109  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 
631 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 
685 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
858 aa  109  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  32.63 
 
 
570 aa  109  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 
623 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
858 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
688 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
613 aa  108  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  25.18 
 
 
708 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  25.67 
 
 
539 aa  107  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  28.02 
 
 
626 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
623 aa  106  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 
657 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
549 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
547 aa  105  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  32.54 
 
 
644 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 
682 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.34 
 
 
660 aa  104  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  21.95 
 
 
609 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 
463 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 
642 aa  103  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 
642 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  31.11 
 
 
430 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  30.13 
 
 
680 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 
537 aa  102  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
560 aa  102  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.24 
 
 
623 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>