263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1619 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
690 aa  1350    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  37.89 
 
 
702 aa  458  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  39.21 
 
 
697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  38.26 
 
 
698 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  38.1 
 
 
696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  36.26 
 
 
715 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.5 
 
 
638 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  32.01 
 
 
566 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
478 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.13 
 
 
642 aa  117  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  33.47 
 
 
680 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
683 aa  115  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  34.66 
 
 
645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  34.66 
 
 
645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  28.49 
 
 
818 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.8 
 
 
680 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 
846 aa  111  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  31.98 
 
 
588 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.88 
 
 
637 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  28.51 
 
 
477 aa  106  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
858 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
858 aa  105  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  32.94 
 
 
618 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 
531 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  31.02 
 
 
623 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  31.65 
 
 
541 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  32.8 
 
 
641 aa  104  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 
560 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
695 aa  103  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 
477 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
525 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  33.88 
 
 
640 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
676 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 
847 aa  101  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  29.48 
 
 
626 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  33.88 
 
 
457 aa  100  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
471 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.35 
 
 
682 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  28.69 
 
 
630 aa  99.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  28.86 
 
 
647 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  25.18 
 
 
637 aa  98.6  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 
708 aa  98.2  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
541 aa  97.4  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 
631 aa  97.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
486 aa  97.8  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
489 aa  97.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  31.75 
 
 
627 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 
686 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
640 aa  95.1  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.28 
 
 
458 aa  94.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
613 aa  94.7  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
649 aa  94.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
649 aa  94.7  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
623 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  36.07 
 
 
539 aa  94  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.92 
 
 
623 aa  94  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  29.15 
 
 
645 aa  93.6  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 
681 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  30.65 
 
 
632 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 
583 aa  92.8  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
688 aa  92.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  29.9 
 
 
599 aa  91.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
568 aa  91.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
686 aa  91.3  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 
457 aa  91.3  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 
858 aa  91.3  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 
683 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  25.77 
 
 
623 aa  90.9  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 
682 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
660 aa  90.5  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.8 
 
 
611 aa  90.1  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 
652 aa  90.1  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
623 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.46 
 
 
619 aa  89  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
475 aa  88.2  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.41 
 
 
622 aa  88.2  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 
608 aa  88.2  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  23.69 
 
 
838 aa  87.8  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  28.1 
 
 
644 aa  87.4  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 
608 aa  86.7  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
632 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
632 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 
685 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 
608 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 
458 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.92 
 
 
920 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 
623 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
613 aa  84.7  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.71 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 
480 aa  84.3  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  28.57 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  27 
 
 
609 aa  84.3  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
546 aa  83.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.03 
 
 
641 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
628 aa  82.8  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>