263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0951 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  99.84 
 
 
632 aa  1205    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  91.14 
 
 
632 aa  1059    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
632 aa  1207    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  57.86 
 
 
623 aa  625  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  57.6 
 
 
623 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  51.57 
 
 
627 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  49.37 
 
 
618 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  42.41 
 
 
599 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  39.25 
 
 
623 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  38.97 
 
 
623 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  37.89 
 
 
619 aa  362  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  38.25 
 
 
611 aa  361  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.75 
 
 
623 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  37.46 
 
 
622 aa  350  6e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  36.41 
 
 
626 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  37.83 
 
 
613 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
484 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.18 
 
 
727 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  33.33 
 
 
588 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.71 
 
 
665 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 
566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  30.59 
 
 
458 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
485 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 
637 aa  104  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
818 aa  104  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  29.05 
 
 
631 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  35.03 
 
 
588 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 
484 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 
482 aa  101  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 
486 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 
486 aa  100  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 
493 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 
484 aa  97.8  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
495 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.57 
 
 
846 aa  95.5  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 
641 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  33.74 
 
 
657 aa  94.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
495 aa  94.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 
587 aa  93.6  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  27.07 
 
 
647 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.79 
 
 
847 aa  92  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  24.05 
 
 
640 aa  91.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  34.17 
 
 
660 aa  91.3  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  30.21 
 
 
640 aa  91.3  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  28.16 
 
 
697 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 
680 aa  89.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.18 
 
 
920 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
456 aa  89.7  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  33.75 
 
 
657 aa  89  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 
688 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 
465 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 
858 aa  87.4  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.48 
 
 
858 aa  87.4  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
690 aa  87.4  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.75 
 
 
541 aa  87.4  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
683 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.07 
 
 
642 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  24.16 
 
 
696 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 
641 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 
457 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 
713 aa  85.5  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 
588 aa  85.1  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
685 aa  85.1  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  28.71 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 
478 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.05 
 
 
531 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 
568 aa  84.3  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 
641 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
548 aa  83.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.44 
 
 
546 aa  83.2  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 
649 aa  82.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  27.61 
 
 
477 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  22.36 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 
554 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 
642 aa  82  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 
554 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 
709 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 
525 aa  82  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.57 
 
 
640 aa  82  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  27.14 
 
 
554 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  33.54 
 
 
585 aa  81.6  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 
638 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  25.08 
 
 
649 aa  81.3  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
640 aa  81.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 
695 aa  81.3  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  32.34 
 
 
682 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  21.35 
 
 
617 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
638 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  31.98 
 
 
549 aa  80.1  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
454 aa  80.1  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
481 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  29.73 
 
 
643 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
667 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>