189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0277 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 472 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  51.83 
 
 		 495 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  51.42 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  50.1 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  50.93 
 
 		 486 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  45.55 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  46.61 
 
 		 487 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  43.09 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  41.24 
 
 		 484 aa  322  9.000000000000001e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  41.12 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  37.8 
 
 		 493 aa  293  6e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  38.6 
 
 		 483 aa  282  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 		 485 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  35.73 
 
 		 456 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  38.04 
 
 		 489 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  38.93 
 
 		 487 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  38.73 
 
 		 487 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  36.29 
 
 		 496 aa  250  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 485 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 		 485 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 		 481 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 613 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 		 481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.55 
 
 		 727 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  31.31 
 
 		 588 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  26.17 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.43 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 		 478 aa  97.4  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 		 632 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  31.73 
 
 		 632 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25.25 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 		 482 aa  93.6  8e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  24.21 
 
 		 477 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  31.41 
 
 		 632 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.8 
 
 		 464 aa  86.7  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  27.07 
 
 		 618 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  33.82 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  29.22 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.66 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.52 
 
 		 818 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.47 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  25.15 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 623 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.57 
 
 		 858 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.57 
 
 		 858 aa  77  0.0000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  33.52 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  27.3 
 
 		 622 aa  76.6  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  24.93 
 
 		 626 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  20.83 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  25.37 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.65 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  26.5 
 
 		 623 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.65 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  23.01 
 
 		 486 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25.85 
 
 		 619 aa  73.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 627 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.04 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  22.89 
 
 		 464 aa  69.7  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.5 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  22 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 623 aa  67.4  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  22.36 
 
 		 847 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  25.71 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  21.65 
 
 		 537 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 		 697 aa  64.3  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  21.03 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  25.59 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  23.05 
 
 		 680 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  24.37 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  24.26 
 
 		 683 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  23.81 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  21.75 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  20.16 
 
 		 696 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  22.67 
 
 		 548 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 		 713 aa  60.1  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 		 652 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  21.47 
 
 		 846 aa  60.1  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  24.2 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  24.44 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  23.83 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  23.4 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 		 638 aa  57.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  23.15 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  24.51 
 
 		 682 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  23.18 
 
 		 631 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  22.96 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  21.68 
 
 		 452 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>