211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2529 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  895    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  34.98 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  32.62 
 
 		 588 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  35.91 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  32.13 
 
 		 585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  25.91 
 
 		 484 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 		 476 aa  120  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 484 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.95 
 
 		 727 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 		 485 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  25.37 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 		 486 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  25.41 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.6 
 
 		 464 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.11 
 
 		 457 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 		 481 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 481 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 640 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 		 489 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.23 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  24.95 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  23.9 
 
 		 484 aa  96.3  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  23.62 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  24.89 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.85 
 
 		 623 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  25.21 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  23.04 
 
 		 456 aa  90.5  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 496 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  26.5 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.35 
 
 		 626 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  24.53 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 		 623 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  23.35 
 
 		 619 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.18 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  21.05 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  22.94 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  23.56 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 713 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 623 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  23 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 632 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.13 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  24.08 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  22.24 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  22.45 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  22 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  23.63 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  22.38 
 
 		 457 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.44 
 
 		 611 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  22.8 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  25 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  24.05 
 
 		 657 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 		 546 aa  67.4  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  22.59 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 		 690 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  24.29 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.09 
 
 		 623 aa  64.7  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  23.55 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  24.28 
 
 		 638 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  22.18 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  21.12 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  21.28 
 
 		 847 aa  62  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  22.89 
 
 		 846 aa  61.6  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  21.95 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  23.51 
 
 		 683 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 641 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  23.72 
 
 		 697 aa  62.4  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  25.87 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  21.91 
 
 		 637 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  23.41 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  25.87 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  25.87 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  22.32 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  25.32 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  22.32 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  22.32 
 
 		 432 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.79 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.68 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  21.4 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  21.4 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.52 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  23.6 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  20.96 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.79 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>