184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0043 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 496 aa  951    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  51.99 
 
 		 493 aa  486  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  43.06 
 
 		 490 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  43.54 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  40.36 
 
 		 484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  39.96 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  44.6 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  43.37 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  45.22 
 
 		 487 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  41.85 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  44.82 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  38.55 
 
 		 464 aa  309  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  36.69 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  41.52 
 
 		 486 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  40.76 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 495 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  31.99 
 
 		 456 aa  240  5e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  34.06 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  31.69 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  30.18 
 
 		 481 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  30.18 
 
 		 481 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  33.18 
 
 		 588 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 		 486 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  29.37 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.43 
 
 		 482 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 		 487 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  32.55 
 
 		 588 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  33.12 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  31.18 
 
 		 585 aa  106  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.9 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.83 
 
 		 619 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 		 613 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.38 
 
 		 727 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  30.21 
 
 		 626 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.7 
 
 		 622 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  29.68 
 
 		 623 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  30.72 
 
 		 623 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.75 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  30.23 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.74 
 
 		 611 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.76 
 
 		 632 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.37 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  24.09 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 		 463 aa  77.8  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  20.87 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  23.31 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 		 632 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.09 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 		 818 aa  70.5  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  23.5 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.38 
 
 		 683 aa  69.7  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  22.03 
 
 		 464 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 683 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.47 
 
 		 478 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 		 627 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  26.53 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.92 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.9 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.23 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.35 
 
 		 858 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.35 
 
 		 858 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  25.06 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 676 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  25.75 
 
 		 618 aa  63.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.39 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  20.64 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  21.41 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  27.04 
 
 		 599 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  25.11 
 
 		 652 aa  60.1  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.12 
 
 		 920 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.62 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 		 583 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  28.46 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 680 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  22.85 
 
 		 568 aa  57  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  22.9 
 
 		 548 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  24.17 
 
 		 531 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.7 
 
 		 665 aa  56.2  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 680 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 682 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 		 660 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 		 685 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  20.27 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 637 aa  54.7  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  25.95 
 
 		 657 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 		 641 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 		 847 aa  54.3  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  30.68 
 
 		 715 aa  53.9  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>