138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1706 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
485 aa  962    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  50.1 
 
 
489 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  44.99 
 
 
490 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  50.51 
 
 
487 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  50.31 
 
 
487 aa  383  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  48.46 
 
 
483 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  43.93 
 
 
493 aa  363  3e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  43.33 
 
 
484 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  42.39 
 
 
484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  43.37 
 
 
496 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  41.89 
 
 
464 aa  310  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  39.92 
 
 
487 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  38.78 
 
 
486 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  35.26 
 
 
484 aa  283  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  37.58 
 
 
456 aa  273  7e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  37.76 
 
 
486 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  36.97 
 
 
495 aa  263  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  38.65 
 
 
472 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  35.54 
 
 
495 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 
486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  29.98 
 
 
481 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 
481 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 
487 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  27.65 
 
 
485 aa  105  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.12 
 
 
727 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.64 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.73 
 
 
588 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
476 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28.49 
 
 
623 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.77 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  25.97 
 
 
623 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  26.89 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.47 
 
 
588 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.93 
 
 
626 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  26.38 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  23.64 
 
 
503 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  24.49 
 
 
640 aa  70.1  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.38 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.82 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.34 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.41 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.84 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  22.95 
 
 
458 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  24.18 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  21.72 
 
 
477 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  22.63 
 
 
457 aa  64.3  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  20.99 
 
 
471 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 
713 aa  61.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.13 
 
 
653 aa  60.8  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  24.18 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  22.95 
 
 
657 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  19.91 
 
 
475 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  24.29 
 
 
452 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  22.31 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  22.69 
 
 
645 aa  57.8  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  22.93 
 
 
485 aa  56.2  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  23.61 
 
 
657 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  23.32 
 
 
619 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 
478 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  40.68 
 
 
614 aa  54.3  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  20.08 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  22.64 
 
 
658 aa  53.9  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 
682 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  25.36 
 
 
622 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  22.5 
 
 
623 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  23.39 
 
 
642 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  20.75 
 
 
632 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  23.5 
 
 
683 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  22 
 
 
453 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 
560 aa  51.6  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  39.68 
 
 
626 aa  51.6  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  24.12 
 
 
676 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  23.03 
 
 
627 aa  51.6  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  23.39 
 
 
639 aa  50.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  24 
 
 
637 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.84 
 
 
681 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.46 
 
 
858 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  23.26 
 
 
704 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.46 
 
 
858 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  23.17 
 
 
459 aa  50.4  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  23.29 
 
 
632 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  21.52 
 
 
657 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  39.68 
 
 
695 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1262  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 
450 aa  49.7  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237896  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  21.39 
 
 
642 aa  49.3  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  23.29 
 
 
632 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  23.65 
 
 
680 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 
631 aa  49.3  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  37.88 
 
 
647 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  20.5 
 
 
638 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  23.39 
 
 
644 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  23.72 
 
 
920 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  23.05 
 
 
618 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  21.86 
 
 
838 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 
531 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  35.38 
 
 
630 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  21.7 
 
 
714 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  21.7 
 
 
667 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>