184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0658 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  86.09 
 
 
487 aa  734    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  85.48 
 
 
487 aa  729    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
489 aa  926    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  58.57 
 
 
483 aa  476  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  45.49 
 
 
493 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  50.1 
 
 
485 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  46.34 
 
 
490 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  43.54 
 
 
496 aa  330  3e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  39.67 
 
 
484 aa  312  1e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  38.93 
 
 
484 aa  307  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  38.4 
 
 
484 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 
486 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  39.31 
 
 
487 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  39.47 
 
 
486 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  38.45 
 
 
464 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  36.4 
 
 
456 aa  278  1e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  37.35 
 
 
495 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  37.4 
 
 
495 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  38.45 
 
 
472 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 
481 aa  146  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  32.23 
 
 
481 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
486 aa  139  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 
485 aa  137  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
476 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 
487 aa  113  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.8 
 
 
452 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.06 
 
 
727 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 
482 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  30.82 
 
 
623 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.7 
 
 
623 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
587 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  30.09 
 
 
623 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 
613 aa  97.8  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  29.39 
 
 
626 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.69 
 
 
588 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.43 
 
 
485 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  25.28 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
704 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.3 
 
 
632 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  31.15 
 
 
618 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.67 
 
 
713 aa  76.6  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  24 
 
 
477 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.74 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
690 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
623 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  30.79 
 
 
632 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.84 
 
 
611 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  22.79 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.41 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25.77 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.41 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 
657 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.63 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.37 
 
 
818 aa  69.3  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.82 
 
 
588 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.59 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.17 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.17 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
682 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.75 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 
640 aa  67.4  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.46 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.06 
 
 
683 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 
463 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 
638 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  25.6 
 
 
637 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  29.67 
 
 
623 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  19.92 
 
 
475 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  24.66 
 
 
631 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  21.72 
 
 
454 aa  64.3  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  29.9 
 
 
599 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  25.91 
 
 
626 aa  63.9  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  20.51 
 
 
471 aa  63.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
682 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
588 aa  63.2  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 
627 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.11 
 
 
653 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 
645 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 
645 aa  60.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 
698 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.3 
 
 
846 aa  60.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25.93 
 
 
560 aa  60.1  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  23.66 
 
 
665 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  25.08 
 
 
622 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 
657 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 
631 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 
566 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  23.53 
 
 
696 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
459 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  24.17 
 
 
702 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  23.55 
 
 
657 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  26.52 
 
 
641 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  23.8 
 
 
623 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  24.24 
 
 
386 aa  57.4  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 
532 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  20.88 
 
 
477 aa  57  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  22.42 
 
 
638 aa  56.6  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  25.32 
 
 
429 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 
681 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>