181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5530 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
486 aa  951    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  91.56 
 
 
486 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  64.07 
 
 
495 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  62.67 
 
 
495 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  51.43 
 
 
484 aa  463  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  50.93 
 
 
472 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  44.51 
 
 
487 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  42.09 
 
 
484 aa  342  7e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  43.24 
 
 
484 aa  332  1e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  40.64 
 
 
493 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  39.59 
 
 
490 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  40.25 
 
 
464 aa  310  4e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  39.47 
 
 
489 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 
483 aa  286  5e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  39.43 
 
 
487 aa  280  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  39.67 
 
 
487 aa  279  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  40.76 
 
 
496 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  37.76 
 
 
485 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  32.99 
 
 
456 aa  266  5e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 
485 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  30.36 
 
 
487 aa  151  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  30.22 
 
 
481 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 
481 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  29.55 
 
 
476 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 
486 aa  130  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.87 
 
 
613 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  26.58 
 
 
727 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.19 
 
 
482 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 
632 aa  103  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  29.89 
 
 
632 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  27.48 
 
 
503 aa  99  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.3 
 
 
588 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.22 
 
 
452 aa  97.1  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
623 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  30.74 
 
 
623 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.3 
 
 
623 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.35 
 
 
626 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  28.65 
 
 
632 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
587 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  32.98 
 
 
585 aa  88.2  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  23.52 
 
 
478 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  29.94 
 
 
618 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 
818 aa  85.1  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.05 
 
 
683 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  21.77 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.38 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.76 
 
 
858 aa  80.9  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.76 
 
 
858 aa  80.5  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  22.12 
 
 
846 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  27.72 
 
 
469 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
682 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  24.52 
 
 
619 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 
704 aa  75.5  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.47 
 
 
713 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  25.83 
 
 
622 aa  74.3  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  24.86 
 
 
485 aa  74.3  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  22.48 
 
 
847 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  27.63 
 
 
627 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 
531 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.39 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  26.63 
 
 
623 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  22.97 
 
 
464 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.3 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.93 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  23.09 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 
623 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  26.62 
 
 
599 aa  67.4  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  27.83 
 
 
541 aa  67.4  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.13 
 
 
457 aa  67  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.2 
 
 
457 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  21.69 
 
 
477 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  23.99 
 
 
690 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.01 
 
 
480 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  21.55 
 
 
457 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  28.43 
 
 
680 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 
469 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  24.35 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  25.35 
 
 
623 aa  62  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  24.29 
 
 
566 aa  62.4  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
459 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 
683 aa  61.6  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  29.19 
 
 
680 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  24.27 
 
 
469 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  23.46 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  24.35 
 
 
637 aa  60.5  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  23.64 
 
 
588 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.87 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  22.57 
 
 
537 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
560 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  21.63 
 
 
464 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 
645 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 
645 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  32.37 
 
 
1363 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 
660 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 
1365 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  22.78 
 
 
631 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  54.9 
 
 
629 aa  57  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  32.37 
 
 
1363 aa  57  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>