206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6507 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
483 aa  927    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  58.37 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  58.4 
 
 
487 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  57.99 
 
 
487 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  48.46 
 
 
485 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  45.14 
 
 
490 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  43.03 
 
 
493 aa  341  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  44.6 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  38.6 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  39.01 
 
 
484 aa  296  4e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 
486 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  38.81 
 
 
484 aa  289  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  40.12 
 
 
487 aa  286  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 
486 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  37.58 
 
 
464 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  38.6 
 
 
472 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  35.35 
 
 
495 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  34.95 
 
 
495 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  34.69 
 
 
456 aa  243  5e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 
486 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 
481 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
481 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  29.21 
 
 
476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.03 
 
 
485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.03 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  31.58 
 
 
613 aa  109  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
482 aa  103  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
487 aa  103  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.63 
 
 
588 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.47 
 
 
704 aa  98.6  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
623 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 
503 aa  94  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  26.17 
 
 
463 aa  93.6  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
627 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  29.43 
 
 
623 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28.83 
 
 
623 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  23.81 
 
 
452 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.71 
 
 
587 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 
458 aa  87  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.64 
 
 
454 aa  84  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  21.68 
 
 
475 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  24.61 
 
 
485 aa  83.2  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  28.04 
 
 
588 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.44 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  20.62 
 
 
471 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
713 aa  79.7  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  30.14 
 
 
618 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  25.3 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
632 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  21.78 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 
683 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 
682 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  21.5 
 
 
477 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.03 
 
 
623 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
681 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
682 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  26.65 
 
 
611 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 
698 aa  71.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  30.8 
 
 
639 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.3 
 
 
585 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  20.2 
 
 
818 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  30.38 
 
 
637 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  25.41 
 
 
457 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  26.57 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 
638 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.57 
 
 
641 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.87 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  21.64 
 
 
478 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.35 
 
 
457 aa  67  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.71 
 
 
566 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.02 
 
 
858 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  29.69 
 
 
641 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.02 
 
 
858 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  23.05 
 
 
696 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  28.07 
 
 
638 aa  65.1  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  22.39 
 
 
486 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  27.88 
 
 
623 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 
640 aa  63.9  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.55 
 
 
640 aa  63.5  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
641 aa  63.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  21.71 
 
 
645 aa  62.8  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  29.69 
 
 
641 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
457 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  23.46 
 
 
642 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
658 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
641 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  24.07 
 
 
702 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.78 
 
 
665 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 
641 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 
641 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
641 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
623 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  29.22 
 
 
599 aa  61.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  20.83 
 
 
477 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.99 
 
 
680 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
623 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  24.37 
 
 
583 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>