199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0684 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  86.09 
 
 		 489 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 487 aa  926    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  99.38 
 
 		 487 aa  922    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  58.61 
 
 		 483 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  51.02 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  43.66 
 
 		 493 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  45.81 
 
 		 490 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  45.22 
 
 		 496 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  40.33 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  40.45 
 
 		 484 aa  320  3e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  38.35 
 
 		 484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  39.26 
 
 		 486 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  39.43 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  40.29 
 
 		 487 aa  296  8e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  39.67 
 
 		 486 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  35.93 
 
 		 456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  36.82 
 
 		 495 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  36.87 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  39.14 
 
 		 472 aa  253  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 		 481 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  33.13 
 
 		 481 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 		 485 aa  133  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 		 476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.86 
 
 		 487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 482 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.83 
 
 		 727 aa  106  9e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  33.02 
 
 		 588 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 		 623 aa  97.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.66 
 
 		 452 aa  95.9  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 		 485 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.53 
 
 		 623 aa  93.6  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  31.08 
 
 		 632 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.94 
 
 		 458 aa  90.1  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.33 
 
 		 587 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.98 
 
 		 464 aa  87  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 704 aa  87.4  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  28.05 
 
 		 613 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  31.1 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  31.1 
 
 		 632 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.19 
 
 		 626 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 623 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  29.44 
 
 		 618 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.68 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 713 aa  80.1  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.88 
 
 		 858 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.88 
 
 		 858 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.71 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  27.86 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  26.17 
 
 		 611 aa  76.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  21.37 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.71 
 
 		 818 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  24.71 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 847 aa  74.3  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.12 
 
 		 622 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.59 
 
 		 588 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 		 623 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  30.03 
 
 		 599 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.61 
 
 		 623 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 637 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  22.84 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  25.38 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 		 638 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  23.8 
 
 		 638 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 		 627 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.19 
 
 		 640 aa  67.8  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 		 682 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  24.2 
 
 		 640 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.5 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.01 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  24.38 
 
 		 638 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.52 
 
 		 682 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  25.6 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  25.77 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 641 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.69 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  22.16 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  24.73 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 		 702 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  21.78 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  24.86 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  22.52 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 641 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 642 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 683 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  22.62 
 
 		 480 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.73 
 
 		 585 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  25.23 
 
 		 653 aa  62  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 		 690 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  23.02 
 
 		 531 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  22.05 
 
 		 486 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  24.78 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  22.92 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  23.51 
 
 		 623 aa  60.5  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  23.86 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>