260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3816 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 623 aa  1226    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  68.26 
 
 		 626 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  84.59 
 
 		 623 aa  1040    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  76.57 
 
 		 623 aa  966    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  53.76 
 
 		 619 aa  618  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  53.11 
 
 		 622 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  50.73 
 
 		 611 aa  558  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  40 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  39.04 
 
 		 623 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  39.65 
 
 		 623 aa  356  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  39.25 
 
 		 632 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  39.25 
 
 		 632 aa  355  1e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  37.72 
 
 		 632 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  38.45 
 
 		 618 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  36.34 
 
 		 627 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  33.59 
 
 		 599 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  30.87 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.96 
 
 		 727 aa  138  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.64 
 
 		 487 aa  124  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 637 aa  123  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  35.89 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  26.38 
 
 		 644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.89 
 
 		 642 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  24 
 
 		 583 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  29.01 
 
 		 457 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 		 457 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  31.44 
 
 		 490 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  25.04 
 
 		 613 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 		 847 aa  112  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 		 486 aa  110  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 554 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 		 614 aa  109  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 548 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  23.97 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  23.97 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 641 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 858 aa  104  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 		 690 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 858 aa  104  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.23 
 
 		 920 aa  104  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 		 457 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  30.4 
 
 		 566 aa  103  9e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 484 aa  103  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.63 
 
 		 846 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.06 
 
 		 458 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 641 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 		 683 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.24 
 
 		 696 aa  101  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  28.75 
 
 		 688 aa  101  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.96 
 
 		 818 aa  100  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  28.38 
 
 		 682 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.29 
 
 		 484 aa  99.8  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28 
 
 		 465 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  22.68 
 
 		 640 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 		 660 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  31.23 
 
 		 457 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  29.79 
 
 		 482 aa  98.2  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.75 
 
 		 493 aa  97.8  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 		 487 aa  97.8  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 		 715 aa  97.4  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 457 aa  97.4  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  25.9 
 
 		 838 aa  96.7  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  22.27 
 
 		 608 aa  95.5  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  22.8 
 
 		 608 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  24 
 
 		 645 aa  94.7  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 		 531 aa  95.1  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  22.64 
 
 		 608 aa  93.6  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 485 aa  93.6  9e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  29.21 
 
 		 456 aa  93.6  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.64 
 
 		 704 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 476 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.01 
 
 		 623 aa  91.7  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  29 
 
 		 541 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  27.85 
 
 		 452 aa  92  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  24.53 
 
 		 525 aa  92  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 489 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 		 640 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 		 495 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 		 637 aa  90.5  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 		 477 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 481 aa  90.1  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  26.89 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 		 546 aa  89.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 588 aa  88.6  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  27.38 
 
 		 665 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  21.17 
 
 		 627 aa  88.2  4e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 640 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.38 
 
 		 541 aa  88.2  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 		 475 aa  88.2  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 		 697 aa  88.2  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.53 
 
 		 547 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 		 481 aa  87.8  6e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 		 685 aa  87.4  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.53 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.53 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>