194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1304 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 481 aa  923    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  98.34 
 
 		 481 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  67.57 
 
 		 476 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  44.44 
 
 		 486 aa  358  9.999999999999999e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  42.04 
 
 		 485 aa  302  9e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  35.8 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  36.34 
 
 		 487 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  31.35 
 
 		 486 aa  153  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 493 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  33 
 
 		 489 aa  143  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 		 484 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  30.97 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  33 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 		 484 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  28.97 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  29.34 
 
 		 483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.72 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 		 485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.4 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.85 
 
 		 727 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.07 
 
 		 613 aa  109  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  29.92 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  27.5 
 
 		 495 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 623 aa  103  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.7 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.48 
 
 		 485 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.9 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  24.23 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.4 
 
 		 464 aa  95.1  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.33 
 
 		 626 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.7 
 
 		 458 aa  90.9  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  25.63 
 
 		 623 aa  90.5  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 		 713 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.9 
 
 		 622 aa  89.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 587 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  25.63 
 
 		 623 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 		 503 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  26.58 
 
 		 619 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.42 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 457 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.52 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.01 
 
 		 611 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.82 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 		 632 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  24.4 
 
 		 457 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 		 480 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  29.8 
 
 		 441 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 		 632 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.03 
 
 		 588 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  22.02 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 		 627 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  27.16 
 
 		 618 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  21.53 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 482 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 		 464 aa  70.5  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  23.65 
 
 		 477 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.48 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  23.66 
 
 		 583 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  23.7 
 
 		 683 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.56 
 
 		 657 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  20.08 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  26.71 
 
 		 599 aa  67  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  26.22 
 
 		 585 aa  66.6  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 		 623 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 463 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  23.76 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 667 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  22.29 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  25.63 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  24.59 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  23.87 
 
 		 657 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.12 
 
 		 680 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  20.88 
 
 		 696 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 667 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  24.84 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 640 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.24 
 
 		 631 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 637 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  24.89 
 
 		 660 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  24.79 
 
 		 695 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 698 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.7 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  22.16 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  23.67 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25.53 
 
 		 560 aa  60.5  0.00000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  22.94 
 
 		 631 aa  60.1  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.3 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>