266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2852 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  100 
 
 		 727 aa  1457    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  33.55 
 
 		 613 aa  173  7.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  31.87 
 
 		 587 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.53 
 
 		 588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 		 713 aa  162  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  31.92 
 
 		 588 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 704 aa  159  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 623 aa  146  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  28.96 
 
 		 623 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.45 
 
 		 585 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  28.46 
 
 		 626 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  29.48 
 
 		 619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 		 485 aa  126  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.13 
 
 		 623 aa  124  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 		 480 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.13 
 
 		 622 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  25.52 
 
 		 696 aa  119  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  28.05 
 
 		 618 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  28.04 
 
 		 632 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 		 632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 		 847 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 		 632 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 		 487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25.3 
 
 		 858 aa  112  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 		 476 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 481 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 		 846 aa  112  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 858 aa  111  5e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 		 484 aa  110  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 		 478 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 		 493 aa  110  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  30.17 
 
 		 627 aa  109  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 482 aa  109  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 623 aa  109  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.25 
 
 		 477 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 		 623 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 486 aa  108  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  27.95 
 
 		 452 aa  108  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 525 aa  107  6e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.27 
 
 		 611 aa  106  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 		 637 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.36 
 
 		 490 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.61 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 588 aa  102  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  28.03 
 
 		 483 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 487 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  27.06 
 
 		 489 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 487 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  27.21 
 
 		 484 aa  99  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  26.39 
 
 		 537 aa  97.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  28.52 
 
 		 599 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  27.1 
 
 		 560 aa  95.1  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 456 aa  95.1  4e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.44 
 
 		 477 aa  94.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  28.03 
 
 		 457 aa  93.6  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 		 637 aa  93.6  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.29 
 
 		 485 aa  94  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  25.79 
 
 		 695 aa  93.6  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 		 456 aa  93.2  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  27.12 
 
 		 485 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  25.38 
 
 		 920 aa  91.3  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 640 aa  90.9  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  26.17 
 
 		 647 aa  90.5  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  25.4 
 
 		 549 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  25.94 
 
 		 657 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 		 583 aa  89  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 554 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 554 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 554 aa  87.8  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 631 aa  87.8  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 		 642 aa  87.8  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  22.87 
 
 		 838 aa  87.4  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 		 495 aa  87.4  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  23.35 
 
 		 465 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 		 546 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  26.55 
 
 		 471 aa  86.7  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  24.06 
 
 		 657 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 		 566 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 		 463 aa  86.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 		 457 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  26.2 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.76 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  25.53 
 
 		 486 aa  86.7  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 		 685 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  32.72 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  26.01 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  24.53 
 
 		 657 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 626 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 682 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 638 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 683 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 683 aa  82.4  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  27.16 
 
 		 688 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>