238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4185 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  75 
 
 
623 aa  865    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
623 aa  1180    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  57.7 
 
 
632 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  57.7 
 
 
632 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  57.64 
 
 
632 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  49.92 
 
 
618 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  50.79 
 
 
627 aa  498  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  39.78 
 
 
623 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.1 
 
 
623 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  36.55 
 
 
611 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  41.61 
 
 
599 aa  352  8e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  37.32 
 
 
623 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  38.01 
 
 
626 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  38.62 
 
 
622 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  36.38 
 
 
619 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  38.5 
 
 
613 aa  329  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 
858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 
858 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.88 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.79 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25.27 
 
 
846 aa  109  2e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
482 aa  108  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 
637 aa  106  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.96 
 
 
471 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 
688 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  24.05 
 
 
583 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
566 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.7 
 
 
631 aa  97.8  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.18 
 
 
847 aa  95.9  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
525 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 
690 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
486 aa  94.4  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  30.65 
 
 
587 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 
631 aa  92  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 
818 aa  91.3  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
490 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
487 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  26.24 
 
 
680 aa  88.6  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  26.68 
 
 
641 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  29.63 
 
 
920 aa  88.6  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  23.23 
 
 
640 aa  89  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.41 
 
 
588 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 
641 aa  88.6  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  27.32 
 
 
386 aa  87  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  27.11 
 
 
641 aa  87  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
486 aa  87  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  25.05 
 
 
639 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
641 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 
484 aa  85.9  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 
531 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 
696 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 
657 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.3 
 
 
683 aa  84.3  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 
641 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 
641 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  24.37 
 
 
640 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 
617 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  27.59 
 
 
713 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
698 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  31.33 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 
493 aa  80.5  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.31 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  25.99 
 
 
432 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.02 
 
 
458 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.52 
 
 
432 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 
637 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 
541 aa  79  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
652 aa  78.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.8 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  24.23 
 
 
665 aa  78.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
553 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
553 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  28.97 
 
 
537 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
553 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.13 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
553 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.66 
 
 
585 aa  78.2  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 
553 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
485 aa  77.8  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  24.14 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  24.14 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 
457 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  25.99 
 
 
432 aa  77  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 
432 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  25.99 
 
 
432 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
485 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.09 
 
 
644 aa  76.6  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  24.14 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  26.64 
 
 
708 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
642 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  32.16 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 
465 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  29.25 
 
 
1363 aa  74.3  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  28.33 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>