263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1486 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  68.26 
 
 		 623 aa  838    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 626 aa  1245    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  68.64 
 
 		 623 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  66.83 
 
 		 623 aa  836    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  53.25 
 
 		 622 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  53.26 
 
 		 619 aa  608  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  46.61 
 
 		 611 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  38 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  37.78 
 
 		 623 aa  346  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  36.72 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  36.72 
 
 		 632 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  37.21 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  37.12 
 
 		 618 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  34.63 
 
 		 632 aa  317  5e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  36.11 
 
 		 627 aa  277  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  32.71 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  31.34 
 
 		 588 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  32.72 
 
 		 920 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  35.86 
 
 		 588 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.35 
 
 		 637 aa  136  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.46 
 
 		 727 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.33 
 
 		 585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 		 485 aa  127  5e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  25.73 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 		 487 aa  124  4e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  24.96 
 
 		 614 aa  124  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 818 aa  121  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 682 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 		 847 aa  118  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.36 
 
 		 631 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 		 713 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 		 846 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  22.71 
 
 		 623 aa  108  3e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  28.02 
 
 		 696 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  23.99 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 554 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  28.36 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  25.33 
 
 		 626 aa  106  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.37 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 704 aa  105  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.36 
 
 		 688 aa  105  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  31.46 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  27.25 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 		 482 aa  103  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.31 
 
 		 541 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  26.76 
 
 		 858 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 637 aa  103  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.25 
 
 		 858 aa  103  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.62 
 
 		 465 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 		 457 aa  101  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  27.97 
 
 		 715 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 		 690 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 		 490 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.56 
 
 		 487 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  27.78 
 
 		 838 aa  98.6  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 		 484 aa  98.2  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28.63 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  25.49 
 
 		 537 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 476 aa  96.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 		 456 aa  95.9  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  23.31 
 
 		 570 aa  95.9  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 		 525 aa  95.5  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.94 
 
 		 486 aa  94.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 		 623 aa  94.4  5e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 685 aa  94.7  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 		 480 aa  94.7  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 		 640 aa  94.4  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 683 aa  94  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 640 aa  94  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  29.03 
 
 		 697 aa  94  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 		 457 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 546 aa  91.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  26.99 
 
 		 695 aa  92  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 583 aa  92  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  29.1 
 
 		 683 aa  91.7  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 481 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  21.08 
 
 		 609 aa  90.9  6e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 		 680 aa  90.9  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 495 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.14 
 
 		 477 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  29.39 
 
 		 489 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  25.76 
 
 		 702 aa  87.4  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 		 680 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  28.78 
 
 		 457 aa  87  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 		 660 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  20.09 
 
 		 627 aa  86.3  0.000000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.22 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 		 548 aa  86.3  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.26 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  32.03 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 		 495 aa  86.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>