240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0396 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  59.93 
 
 
608 aa  717    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  60.26 
 
 
608 aa  715    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
609 aa  1236    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  59.61 
 
 
608 aa  712    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  47.49 
 
 
617 aa  551  1e-155  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  46.29 
 
 
614 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  47.11 
 
 
623 aa  531  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  46.78 
 
 
623 aa  522  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  35.52 
 
 
628 aa  353  5e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  23.5 
 
 
698 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 
637 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
465 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.44 
 
 
588 aa  112  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.29 
 
 
471 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  27.78 
 
 
702 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.6 
 
 
685 aa  108  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  26.8 
 
 
537 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
645 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
645 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
456 aa  104  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  21.95 
 
 
696 aa  103  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.19 
 
 
638 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
683 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
683 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  23.28 
 
 
613 aa  101  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 
642 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 
695 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  25.57 
 
 
838 aa  99  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  22.6 
 
 
623 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  29.6 
 
 
486 aa  98.6  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.28 
 
 
477 aa  97.8  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
858 aa  97.4  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  25.65 
 
 
858 aa  97.1  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 
489 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  28.95 
 
 
665 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.16 
 
 
682 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  31.39 
 
 
629 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  23.92 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 
680 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.34 
 
 
637 aa  90.9  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  29 
 
 
463 aa  90.5  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.75 
 
 
549 aa  90.5  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.32 
 
 
846 aa  89.7  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  29.59 
 
 
640 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
697 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  30 
 
 
638 aa  89.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  21.43 
 
 
622 aa  89  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 
680 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  24.83 
 
 
477 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  25.23 
 
 
568 aa  87.4  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 
631 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
858 aa  86.7  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  25.13 
 
 
715 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  25.57 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  24.66 
 
 
920 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  23.49 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  27.65 
 
 
583 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  25.25 
 
 
676 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.46 
 
 
847 aa  84.7  0.000000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  29.28 
 
 
641 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  27 
 
 
690 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 
560 aa  84  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
642 aa  84  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  23.1 
 
 
623 aa  84  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  27.01 
 
 
641 aa  84  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
682 aa  83.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 
818 aa  83.2  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  29.02 
 
 
443 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  24.92 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 
637 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 
638 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 
652 aa  82.4  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
638 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  22.61 
 
 
611 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
641 aa  82  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  26.53 
 
 
708 aa  82  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24 
 
 
623 aa  81.6  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  25.84 
 
 
631 aa  81.3  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
657 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  27.24 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  24.83 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  31.19 
 
 
660 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.39 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  30.52 
 
 
386 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 
640 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  22.62 
 
 
546 aa  80.1  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  23.34 
 
 
566 aa  79  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 
657 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  31.8 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  31.8 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  28.5 
 
 
626 aa  79  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  27.68 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 
547 aa  78.6  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>