170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0339 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  94.75 
 
 
495 aa  917    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
495 aa  989    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  64.27 
 
 
486 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  64.07 
 
 
486 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  48.89 
 
 
484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  51.83 
 
 
472 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  42.14 
 
 
487 aa  353  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  40.04 
 
 
484 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  38.01 
 
 
484 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  39.52 
 
 
490 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  38.21 
 
 
464 aa  294  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  34.47 
 
 
493 aa  259  7e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  34.82 
 
 
456 aa  259  9e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  37.4 
 
 
489 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  35.35 
 
 
483 aa  254  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  36.75 
 
 
487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  35.54 
 
 
485 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  36.55 
 
 
487 aa  240  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  34.06 
 
 
496 aa  233  5e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 
485 aa  153  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.1 
 
 
487 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 
486 aa  121  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 
476 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 
613 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 
482 aa  102  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 
481 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  30.84 
 
 
623 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 
481 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  28.92 
 
 
623 aa  96.3  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
632 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
632 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  28.1 
 
 
623 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.08 
 
 
818 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  25.88 
 
 
626 aa  90.5  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  27.81 
 
 
632 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 
485 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.08 
 
 
452 aa  86.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.87 
 
 
622 aa  83.2  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  26.2 
 
 
618 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.85 
 
 
683 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  24.08 
 
 
727 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25.15 
 
 
619 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  21.93 
 
 
478 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  27.89 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  26.46 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  23.33 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  21.88 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  22.78 
 
 
477 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  23.6 
 
 
503 aa  72.4  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.46 
 
 
682 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 
627 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 
452 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  22.63 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.98 
 
 
566 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  26.38 
 
 
713 aa  69.3  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  20.63 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  20.63 
 
 
858 aa  68.6  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  25 
 
 
599 aa  67  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.11 
 
 
588 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 
452 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 
681 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  25.47 
 
 
585 aa  64.3  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 
680 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 
482 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
680 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  22.74 
 
 
458 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  23.89 
 
 
611 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
587 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 
459 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  21.9 
 
 
847 aa  61.2  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  23.72 
 
 
697 aa  60.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  23.22 
 
 
631 aa  60.5  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 
623 aa  60.5  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 
548 aa  60.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  22.66 
 
 
457 aa  60.1  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  23.47 
 
 
630 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 
546 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  22.09 
 
 
457 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  20.75 
 
 
696 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  22.07 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  22.42 
 
 
631 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  22.15 
 
 
457 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  21.93 
 
 
537 aa  55.1  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  22.4 
 
 
539 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  25.12 
 
 
688 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  22.39 
 
 
683 aa  54.3  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  52.63 
 
 
629 aa  53.5  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  22.83 
 
 
637 aa  53.5  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  22.67 
 
 
685 aa  53.5  0.000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  23.03 
 
 
623 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  23.33 
 
 
560 aa  53.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  22.24 
 
 
463 aa  52.8  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  23.99 
 
 
690 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  22.42 
 
 
466 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  22.13 
 
 
454 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  22.11 
 
 
457 aa  52  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  20.12 
 
 
846 aa  51.6  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  20.34 
 
 
525 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>