183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3478 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
503 aa  959    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  33.52 
 
 
485 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  33.68 
 
 
588 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  36.97 
 
 
587 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  32.82 
 
 
588 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  27.65 
 
 
486 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25.34 
 
 
452 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  27.72 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  35.33 
 
 
585 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  27.48 
 
 
619 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 
481 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
481 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 
484 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  27.47 
 
 
486 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  24.67 
 
 
482 aa  99  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  28.3 
 
 
622 aa  98.2  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  26.31 
 
 
476 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  26.39 
 
 
483 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  25.42 
 
 
487 aa  95.1  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.19 
 
 
727 aa  93.6  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 
613 aa  93.2  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
484 aa  92.8  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  22.44 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  25.93 
 
 
454 aa  90.9  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
485 aa  90.9  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 
486 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  24.62 
 
 
489 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
632 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
632 aa  87.4  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
632 aa  86.7  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.14 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  22.28 
 
 
531 aa  84  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  24.08 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
704 aa  83.2  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
623 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.11 
 
 
623 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  24.38 
 
 
490 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.54 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.03 
 
 
477 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 
713 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  26.87 
 
 
618 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.33 
 
 
611 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  26.59 
 
 
623 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 
487 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  24.03 
 
 
487 aa  77  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.81 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  23.06 
 
 
626 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  24.34 
 
 
495 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  26.17 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  23.64 
 
 
485 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  21.85 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 
495 aa  72.8  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  23.21 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  23.21 
 
 
554 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  23.04 
 
 
554 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  21.26 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  21.26 
 
 
858 aa  69.3  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  23.75 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  26.13 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.98 
 
 
489 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  27.6 
 
 
680 aa  67  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  23.06 
 
 
548 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  22.68 
 
 
539 aa  63.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 
623 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  23.92 
 
 
482 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  23.72 
 
 
457 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  24.6 
 
 
464 aa  62.4  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.24 
 
 
457 aa  60.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.53 
 
 
458 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  23.25 
 
 
546 aa  60.8  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  21.07 
 
 
537 aa  60.1  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  22.96 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  22.46 
 
 
457 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 
484 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 
627 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.98 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  23.56 
 
 
599 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
642 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 
657 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  25.43 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  20.23 
 
 
457 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  22.38 
 
 
608 aa  57  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  22.38 
 
 
608 aa  57  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  21.49 
 
 
480 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.53 
 
 
456 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 
683 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 
640 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  22.35 
 
 
608 aa  55.1  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  25.42 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
463 aa  54.7  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 
547 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  23.48 
 
 
413 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 
631 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 
688 aa  54.3  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 
547 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 
547 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  23.85 
 
 
547 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>