222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2445 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2445  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 413 aa  832    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  30.59 
 
 		 464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  25.8 
 
 		 477 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.58 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.92 
 
 		 477 aa  123  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 		 456 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 		 560 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  24.78 
 
 		 652 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 547 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  24.4 
 
 		 547 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 547 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  24.4 
 
 		 547 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 547 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 547 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 547 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  24.66 
 
 		 657 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  22.55 
 
 		 525 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  23.29 
 
 		 920 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  25.81 
 
 		 546 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.36 
 
 		 631 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  24.47 
 
 		 630 aa  91.3  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  22.1 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.27 
 
 		 683 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  26.49 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  21.53 
 
 		 685 aa  80.9  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  22.44 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  23.08 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  23.98 
 
 		 680 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.7 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  23.97 
 
 		 482 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  21.79 
 
 		 480 aa  79.7  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 637 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 676 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  23.05 
 
 		 548 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  22.84 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  23.34 
 
 		 683 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  23.43 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 		 688 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  25.09 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  26.14 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  23.35 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  23.15 
 
 		 681 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 		 680 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  21.51 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  23.7 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.27 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  25.41 
 
 		 640 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 457 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  22.74 
 
 		 658 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  26.04 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  22.99 
 
 		 647 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  23.78 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  24.94 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 640 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  24.43 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  23.24 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  24.04 
 
 		 568 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  23.02 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  23.84 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  24.14 
 
 		 458 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  22.83 
 
 		 642 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  22.03 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  24.66 
 
 		 708 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  26.09 
 
 		 457 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  25.78 
 
 		 1363 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  24.14 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  21.19 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.1 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  23.23 
 
 		 637 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  26.09 
 
 		 469 aa  70.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.36 
 
 		 585 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  23.86 
 
 		 551 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 		 457 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  24.06 
 
 		 709 aa  70.1  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 		 541 aa  69.7  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 		 858 aa  70.1  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  25.55 
 
 		 680 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 		 858 aa  69.7  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  24.18 
 
 		 611 aa  69.7  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  20.43 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  25.85 
 
 		 1363 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  21.57 
 
 		 638 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  22.3 
 
 		 640 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  20.27 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  22.62 
 
 		 641 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>