252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2243 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 519 aa  1060    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  57.12 
 
 		 537 aa  628  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  36.49 
 
 		 525 aa  335  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  38.42 
 
 		 480 aa  326  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  32.77 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  30.57 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 		 486 aa  237  4e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  28.89 
 
 		 613 aa  229  1e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  30.99 
 
 		 531 aa  227  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  28.93 
 
 		 838 aa  193  7e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  34.18 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  35.49 
 
 		 568 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  32.85 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 		 637 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  27.95 
 
 		 477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.05 
 
 		 477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  31.34 
 
 		 583 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.86 
 
 		 858 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.86 
 
 		 858 aa  155  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 532 aa  152  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 		 846 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  31.69 
 
 		 443 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  24.58 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.43 
 
 		 464 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 		 858 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 		 847 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  28.64 
 
 		 818 aa  137  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  34.22 
 
 		 586 aa  136  9e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.53 
 
 		 475 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 		 623 aa  135  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.24 
 
 		 459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.52 
 
 		 458 aa  134  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  26.73 
 
 		 627 aa  131  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.31 
 
 		 464 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  32.47 
 
 		 647 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  24.24 
 
 		 463 aa  130  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  30.97 
 
 		 683 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  34.84 
 
 		 645 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  34.84 
 
 		 645 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 456 aa  123  7e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.06 
 
 		 642 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  29.84 
 
 		 680 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 		 682 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 		 680 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  23.46 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.65 
 
 		 638 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  24.91 
 
 		 475 aa  117  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  26.97 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 		 683 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 		 617 aa  111  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  23.44 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  29.77 
 
 		 696 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  27.85 
 
 		 920 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 614 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 		 657 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.18 
 
 		 631 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.6 
 
 		 681 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 		 697 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.7 
 
 		 629 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  26.74 
 
 		 628 aa  107  5e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.62 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 		 480 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  22.2 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  23.62 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  34.56 
 
 		 641 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 		 702 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1551  flagellar hook-associated protein FlgK  21.81 
 
 		 432 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.890668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1669  flagellar hook-associated protein FlgK  21.81 
 
 		 432 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 		 682 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  22.83 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  31.56 
 
 		 652 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 		 613 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  24.86 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  21.81 
 
 		 432 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  21.81 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  29.44 
 
 		 660 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  21.62 
 
 		 432 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  33.18 
 
 		 453 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  25.07 
 
 		 727 aa  98.6  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.95 
 
 		 457 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  27.34 
 
 		 630 aa  98.2  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 		 645 aa  98.2  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1351  flagellar hook-associated protein FlgK  23.61 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 623 aa  97.8  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 		 455 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  23.11 
 
 		 469 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  28.7 
 
 		 686 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.5 
 
 		 657 aa  96.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 695 aa  96.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 608 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  30.73 
 
 		 539 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>