255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0192 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  100 
 
 
838 aa  1732    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  37.26 
 
 
471 aa  257  6e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  38.39 
 
 
486 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  34.25 
 
 
541 aa  243  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  37.01 
 
 
637 aa  240  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  34.73 
 
 
531 aa  235  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  34.48 
 
 
568 aa  234  7.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  33.84 
 
 
525 aa  233  8.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  35.27 
 
 
480 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  34.86 
 
 
627 aa  219  2e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  34.57 
 
 
623 aa  209  2e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  37.72 
 
 
570 aa  207  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  34.94 
 
 
489 aa  207  6e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  36.11 
 
 
708 aa  191  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  32.09 
 
 
537 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  29.76 
 
 
818 aa  185  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 
583 aa  183  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  34.47 
 
 
443 aa  181  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  34.83 
 
 
858 aa  180  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 
858 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 
519 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 
858 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  38.1 
 
 
532 aa  175  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  36.86 
 
 
586 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  30.23 
 
 
847 aa  171  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  29.56 
 
 
846 aa  169  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.54 
 
 
477 aa  160  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 
478 aa  158  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  30.3 
 
 
477 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.14 
 
 
456 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  28.82 
 
 
464 aa  140  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
463 aa  139  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
465 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  35.08 
 
 
430 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  29.33 
 
 
613 aa  139  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 
475 aa  138  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 
463 aa  137  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
697 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
682 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  33.1 
 
 
637 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.61 
 
 
645 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.61 
 
 
645 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.55 
 
 
683 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2563  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 
481 aa  125  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  34.71 
 
 
642 aa  124  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  31.09 
 
 
482 aa  124  7e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 
614 aa  124  7e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.17 
 
 
920 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 
549 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 
702 aa  121  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0708  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
623 aa  121  7e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00565259  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  31.05 
 
 
647 aa  120  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  28.8 
 
 
696 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 
688 aa  119  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  27.92 
 
 
680 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  26.42 
 
 
623 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  26.09 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
645 aa  115  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  28.01 
 
 
469 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0305  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
620 aa  114  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  26.65 
 
 
617 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 
681 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1814  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
608 aa  113  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  26.62 
 
 
680 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 
608 aa  112  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  32.7 
 
 
640 aa  111  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 
652 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 
459 aa  110  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  25.75 
 
 
458 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 
715 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1640  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 
608 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 
640 aa  109  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
560 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  26.62 
 
 
681 aa  108  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0566  flagellar hook-associated protein FlgK  24.5 
 
 
628 aa  107  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  26.3 
 
 
686 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 
686 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 
676 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.8 
 
 
653 aa  107  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  26.27 
 
 
682 aa  105  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  28.47 
 
 
457 aa  105  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.8 
 
 
631 aa  105  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
457 aa  104  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 
657 aa  104  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  28.81 
 
 
619 aa  103  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  29.03 
 
 
622 aa  103  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  23.36 
 
 
630 aa  102  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  26.46 
 
 
640 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.4 
 
 
611 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  30.93 
 
 
698 aa  103  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 
657 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.71 
 
 
657 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.61 
 
 
695 aa  101  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  29.12 
 
 
665 aa  100  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.41 
 
 
644 aa  99.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  25.57 
 
 
609 aa  99  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
672 aa  99  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.78 
 
 
626 aa  98.6  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  25.59 
 
 
466 aa  98.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>