257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4711 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  67.91 
 
 
642 aa  811    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  70.09 
 
 
645 aa  850    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  70.09 
 
 
645 aa  850    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
641 aa  1284    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  39.04 
 
 
645 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  41.59 
 
 
629 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  39.44 
 
 
631 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  38.34 
 
 
652 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  38.43 
 
 
657 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  37.71 
 
 
638 aa  379  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  35.99 
 
 
647 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  36 
 
 
631 aa  362  8e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  37.61 
 
 
659 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  37.41 
 
 
657 aa  351  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  349  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
714 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  37.12 
 
 
657 aa  348  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  35.52 
 
 
683 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  37.16 
 
 
667 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  35.02 
 
 
637 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
667 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  37.76 
 
 
665 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  36.73 
 
 
643 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  36.73 
 
 
643 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  36.73 
 
 
643 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  37.31 
 
 
665 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  35.82 
 
 
660 aa  323  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  32.31 
 
 
644 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  32.31 
 
 
682 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06163  flagellar hook-associated protein FlgK  34.59 
 
 
624 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.557443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01003  flagellar hook-associated protein FlgK  34.59 
 
 
624 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 
680 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  32.7 
 
 
681 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  33.02 
 
 
640 aa  296  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  31.69 
 
 
680 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.58 
 
 
676 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1897  flagellar hook-associated protein FlgK  33.28 
 
 
626 aa  287  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.844089  normal  0.0573856 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 
658 aa  283  5.000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  34.29 
 
 
653 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.19 
 
 
683 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 
672 aa  280  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  33.89 
 
 
642 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 
686 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  32.6 
 
 
681 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 
695 aa  275  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  30.61 
 
 
686 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 
688 aa  274  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  31.14 
 
 
640 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.61 
 
 
682 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  31.39 
 
 
691 aa  263  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  36.67 
 
 
546 aa  262  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  33.94 
 
 
548 aa  253  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  32.87 
 
 
640 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
547 aa  249  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  31.26 
 
 
642 aa  249  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
660 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  35.09 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  35.09 
 
 
547 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  34.67 
 
 
547 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  35.09 
 
 
547 aa  247  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  34.86 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  34.86 
 
 
547 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  33.96 
 
 
539 aa  243  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004164  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 
646 aa  241  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 
638 aa  239  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.15 
 
 
685 aa  237  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  29.86 
 
 
638 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2329  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
626 aa  237  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  34.23 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  34.23 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  34.23 
 
 
554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 
642 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  35.21 
 
 
553 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
641 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  30.18 
 
 
639 aa  233  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  29.33 
 
 
640 aa  233  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.65 
 
 
641 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  29.53 
 
 
641 aa  228  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.29 
 
 
638 aa  227  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  34.97 
 
 
568 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01297  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 
637 aa  227  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  34.55 
 
 
541 aa  222  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  30.44 
 
 
637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1783  flagellar hook-associated protein FlgK  27.67 
 
 
624 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
641 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
641 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
641 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1486  flagellar hook-associated protein  28.29 
 
 
665 aa  220  7.999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1877  flagellar hook-associated protein FlgK  35.33 
 
 
556 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>