281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2041 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
463 aa  922    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  56.18 
 
 
475 aa  501  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  44.12 
 
 
472 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  34.27 
 
 
459 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  35.66 
 
 
482 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  33.12 
 
 
463 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  32.35 
 
 
480 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 
486 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  32.85 
 
 
482 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  27.04 
 
 
541 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.95 
 
 
525 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 
466 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  31.67 
 
 
443 aa  170  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  28.73 
 
 
531 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  28.05 
 
 
471 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
456 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.21 
 
 
477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.14 
 
 
637 aa  157  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
478 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 
489 aa  152  8e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  27.53 
 
 
477 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
583 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  34.66 
 
 
570 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0208  flagellar hook-associated protein FlgK  31.39 
 
 
462 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.750314  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 
627 aa  144  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  30.49 
 
 
623 aa  142  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
568 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  28.99 
 
 
838 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  32.72 
 
 
858 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  31.64 
 
 
708 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 
465 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 
858 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
858 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  27.93 
 
 
457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.18 
 
 
457 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 
637 aa  123  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2436  flagellar hook-associated protein FlgK  29.49 
 
 
586 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.03 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  33.12 
 
 
647 aa  120  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.28 
 
 
458 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
683 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  26.95 
 
 
847 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.85 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  27.66 
 
 
457 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 
682 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 
453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  26.78 
 
 
484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 
532 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  31.32 
 
 
614 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  25.41 
 
 
457 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  32.15 
 
 
640 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 
846 aa  114  5e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 
681 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.47 
 
 
645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 
657 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.47 
 
 
645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.6 
 
 
676 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.58 
 
 
680 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  27.64 
 
 
630 aa  110  5e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
547 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.1 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.1 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 
680 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  32.11 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.1 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 
547 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  32.11 
 
 
547 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 
547 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 
547 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.38 
 
 
920 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.64 
 
 
631 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  28.84 
 
 
681 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.38 
 
 
649 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  26.26 
 
 
453 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 
657 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  25.93 
 
 
537 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0672  flagellar hook-associated protein FlgK  24.41 
 
 
430 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0730204 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  31.08 
 
 
649 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  32.92 
 
 
642 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.84 
 
 
546 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  29.57 
 
 
644 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  25.54 
 
 
441 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 
642 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 
454 aa  104  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.85 
 
 
685 aa  104  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
553 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
553 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
553 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
553 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
553 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 
482 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  31.6 
 
 
640 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  28.85 
 
 
696 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  29.18 
 
 
695 aa  103  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  31.08 
 
 
657 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  30.53 
 
 
686 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  27.84 
 
 
560 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  27.54 
 
 
480 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  29.31 
 
 
658 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>