271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3043 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 477 aa  957    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  71.7 
 
 		 477 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  63.81 
 
 		 478 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  41.6 
 
 		 465 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  41.6 
 
 		 482 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  43.94 
 
 		 480 aa  329  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  40.83 
 
 		 456 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  36.48 
 
 		 464 aa  262  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  33.07 
 
 		 480 aa  237  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  32.72 
 
 		 471 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  31.57 
 
 		 531 aa  216  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  32.26 
 
 		 525 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  32.59 
 
 		 486 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 541 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.77 
 
 		 457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  29.64 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 		 475 aa  177  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  28.31 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  30.11 
 
 		 457 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 		 463 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 482 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  28.42 
 
 		 464 aa  167  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  29.5 
 
 		 454 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  30.32 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  29.21 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.4 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  32.52 
 
 		 683 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  31.55 
 
 		 554 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.54 
 
 		 838 aa  160  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 		 457 aa  160  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.91 
 
 		 682 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  29.69 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  34.12 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 		 652 aa  159  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  32.24 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  31.2 
 
 		 547 aa  157  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  30.57 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  33.43 
 
 		 688 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  32.79 
 
 		 647 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.63 
 
 		 682 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  31.61 
 
 		 681 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  27.41 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  28.9 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  34.11 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  28.54 
 
 		 443 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 		 676 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  31.87 
 
 		 631 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 		 553 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.68 
 
 		 920 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 		 546 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 		 858 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  27.99 
 
 		 858 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  27.71 
 
 		 475 aa  146  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  29.31 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2513  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00819132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  26.92 
 
 		 453 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  33.72 
 
 		 637 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  31.11 
 
 		 640 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.54 
 
 		 680 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 		 548 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 		 680 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 		 629 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 519 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 637 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 		 549 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  29.16 
 
 		 642 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2609  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0376926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 		 631 aa  138  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 		 847 aa  138  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  24.63 
 
 		 458 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  27.49 
 
 		 537 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  31.3 
 
 		 685 aa  136  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.08 
 
 		 642 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  24.42 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  30.75 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 698 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 		 846 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  26.15 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 		 640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 		 681 aa  131  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 466 aa  131  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  30.22 
 
 		 653 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0094  flagellar hook-associated protein FlgK  28.87 
 
 		 708 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>