267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2001 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
715 aa  1472    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  47.7 
 
 
698 aa  651    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  44.32 
 
 
702 aa  610  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  44.41 
 
 
696 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  45.03 
 
 
697 aa  556  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  36.26 
 
 
690 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  35.15 
 
 
637 aa  133  9e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  33.2 
 
 
464 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  33.6 
 
 
653 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  34.68 
 
 
478 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  35.51 
 
 
682 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  34.04 
 
 
477 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  34.51 
 
 
613 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.31 
 
 
920 aa  124  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  33.47 
 
 
480 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  33.04 
 
 
486 aa  123  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 
695 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 
683 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.2 
 
 
645 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  32.32 
 
 
645 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.2 
 
 
645 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  34.94 
 
 
477 aa  120  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  35.22 
 
 
680 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  35.46 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  32.16 
 
 
583 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  30.83 
 
 
471 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  33.48 
 
 
465 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 
631 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  32.68 
 
 
541 aa  118  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.28 
 
 
680 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  31.56 
 
 
660 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  32.63 
 
 
458 aa  117  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  30.57 
 
 
642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  32.2 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
623 aa  114  4.0000000000000004e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  31.05 
 
 
568 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  30.04 
 
 
685 aa  114  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  33.76 
 
 
631 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0786  flagellar hook-associated protein FlgK  32.06 
 
 
623 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  30.83 
 
 
647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  32.79 
 
 
676 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  29.52 
 
 
566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  33.2 
 
 
638 aa  111  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  30.3 
 
 
641 aa  111  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  32 
 
 
644 aa  111  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 
525 aa  111  6e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
847 aa  110  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  29.27 
 
 
838 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 
659 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  32.52 
 
 
482 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 
554 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 
554 aa  107  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  29.63 
 
 
630 aa  107  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
547 aa  107  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0100  flagellar hook-associated protein FlgK  28.75 
 
 
617 aa  107  6e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  32.45 
 
 
554 aa  107  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.41 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  33.08 
 
 
629 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  32.67 
 
 
464 aa  107  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.41 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
547 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.2 
 
 
637 aa  107  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 
686 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.94 
 
 
665 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  31.82 
 
 
456 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1788  flagellar hook-associated protein FlgK  30.74 
 
 
532 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  31.94 
 
 
665 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  29.17 
 
 
657 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  30.24 
 
 
546 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 
643 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 
643 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 
643 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
714 aa  105  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 
614 aa  105  4e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  29.35 
 
 
667 aa  105  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  27.73 
 
 
541 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  31.06 
 
 
560 aa  104  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  29.83 
 
 
683 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
660 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
858 aa  103  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  30 
 
 
657 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  31.22 
 
 
686 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
657 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  27.33 
 
 
457 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  28.92 
 
 
627 aa  101  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  31.91 
 
 
640 aa  101  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  31.65 
 
 
858 aa  101  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  31.98 
 
 
459 aa  101  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  29.68 
 
 
457 aa  101  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>