256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3362 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
458 aa  906    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  99.13 
 
 
458 aa  899    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  38.29 
 
 
453 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  38.29 
 
 
453 aa  318  9e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  40.83 
 
 
455 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  37.77 
 
 
457 aa  300  5e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  37.99 
 
 
457 aa  296  5e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  38.21 
 
 
457 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  36.52 
 
 
452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  37.96 
 
 
457 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  36.52 
 
 
452 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 
429 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  36.6 
 
 
454 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  36.17 
 
 
457 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  36.24 
 
 
457 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  35 
 
 
457 aa  243  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  36.31 
 
 
680 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  35.47 
 
 
680 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  33.51 
 
 
683 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  27.98 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  31.97 
 
 
682 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.92 
 
 
546 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.54 
 
 
681 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  34.64 
 
 
652 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  34.15 
 
 
682 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  33.74 
 
 
541 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
480 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  33.94 
 
 
631 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  32.93 
 
 
686 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  32.09 
 
 
676 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  32.21 
 
 
539 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  28.82 
 
 
458 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  27.57 
 
 
464 aa  144  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 
471 aa  143  6e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.48 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.12 
 
 
920 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  32.53 
 
 
686 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  32.84 
 
 
637 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.63 
 
 
647 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.32 
 
 
477 aa  141  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  31.8 
 
 
631 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  32.31 
 
 
549 aa  138  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  26.25 
 
 
486 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
547 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 
638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1814  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  30.15 
 
 
547 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  26.61 
 
 
478 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 
688 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.36 
 
 
531 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 
432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
553 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  34.14 
 
 
640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  29.94 
 
 
637 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
640 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.37 
 
 
456 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 
638 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.29 
 
 
695 aa  130  6e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
640 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  30.86 
 
 
681 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
685 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 
642 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3642  flagellar hook-associated protein FlgK  26.72 
 
 
432 aa  126  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
641 aa  126  7e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  34.23 
 
 
657 aa  126  9e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1704  flagellar hook-associated protein FlgK  26.55 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  32.83 
 
 
642 aa  126  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 
645 aa  125  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  29.45 
 
 
641 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.91 
 
 
525 aa  124  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1555  flagellar hook-associated protein FlgK  27.1 
 
 
432 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163445  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
641 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
641 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 
541 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  28.66 
 
 
680 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
645 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
645 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
641 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1736  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  29.01 
 
 
641 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  28.4 
 
 
386 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1526  flagellar hook-associated protein FlgK  26.45 
 
 
432 aa  120  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0305654  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  29.72 
 
 
658 aa  120  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1515  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 
432 aa  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  29.85 
 
 
649 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
641 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 
489 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
548 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>