265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04918 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  86.43 
 
 
457 aa  813    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  100 
 
 
457 aa  927    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  44.54 
 
 
454 aa  404  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  40.61 
 
 
457 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  39.17 
 
 
457 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  44.35 
 
 
455 aa  331  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  38.04 
 
 
457 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  38.26 
 
 
457 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  37.77 
 
 
458 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  37.55 
 
 
458 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  37.39 
 
 
457 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  35.81 
 
 
453 aa  288  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  35.45 
 
 
453 aa  283  3.0000000000000004e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  30.54 
 
 
429 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  31.45 
 
 
452 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  31.02 
 
 
452 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  29.77 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  33.54 
 
 
681 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  33.13 
 
 
680 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  27.73 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 
682 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  27.09 
 
 
478 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  29.94 
 
 
688 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  31.46 
 
 
676 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  32.2 
 
 
680 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  34.53 
 
 
637 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  28.72 
 
 
456 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  27.86 
 
 
458 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 
649 aa  149  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  33.14 
 
 
649 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  30.37 
 
 
920 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 
683 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  32.01 
 
 
652 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  30.27 
 
 
682 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  29.57 
 
 
640 aa  147  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 
547 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0769  flagellar hook-associated protein FlgK  28.69 
 
 
466 aa  145  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  31.96 
 
 
647 aa  143  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
686 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  31.19 
 
 
653 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  28.12 
 
 
631 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.25 
 
 
547 aa  140  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
547 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
547 aa  138  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
547 aa  138  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.04 
 
 
547 aa  139  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.41 
 
 
547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 
547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.41 
 
 
547 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  31.79 
 
 
658 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 
638 aa  136  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
638 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  30.37 
 
 
548 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  30.12 
 
 
541 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  27.19 
 
 
686 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  27.68 
 
 
644 aa  134  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 
463 aa  134  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
640 aa  133  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  26.99 
 
 
465 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1506  flagellar hook-associated protein FlgK  28.79 
 
 
681 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29 
 
 
657 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 
480 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  28.17 
 
 
631 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  24.3 
 
 
464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02919  Flagellar hook-associated protein  30.18 
 
 
680 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0989  flagellar hook-associated protein FlgK  27.86 
 
 
482 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  28.74 
 
 
657 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.91 
 
 
489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  29.38 
 
 
482 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  28.83 
 
 
539 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  30.13 
 
 
480 aa  127  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  28.44 
 
 
657 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  32.16 
 
 
645 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  32.16 
 
 
645 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.25 
 
 
641 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3091  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 
641 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.348969  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
641 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  28.99 
 
 
641 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
554 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
554 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 
554 aa  124  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2953  flagellar hook-associated protein FlgK  28.14 
 
 
641 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 
695 aa  123  6e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 
629 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  29.85 
 
 
546 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 
531 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 
638 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  30.51 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 
641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 
640 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  29.97 
 
 
660 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  27.91 
 
 
641 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  28.66 
 
 
641 aa  120  7e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  29.22 
 
 
667 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>