268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2422 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2524  flagellar hook-associated protein FlgK  56.7 
 
 
702 aa  805    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  47.7 
 
 
715 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  51.77 
 
 
696 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  49.35 
 
 
697 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 
698 aa  1424    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  38.26 
 
 
690 aa  451  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  33.75 
 
 
566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 
640 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  35.29 
 
 
478 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  23.5 
 
 
609 aa  135  3e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 
477 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  34 
 
 
477 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  37.15 
 
 
647 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  33.33 
 
 
653 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1963  flagellar hook-associated protein FlgK  31.48 
 
 
645 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  33.61 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1139  flagellar hook-associated protein FlgK  30.59 
 
 
614 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  33.91 
 
 
465 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  31.27 
 
 
640 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  33.61 
 
 
645 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  33.61 
 
 
645 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  33.06 
 
 
642 aa  127  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  127  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  30.19 
 
 
547 aa  126  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  32.42 
 
 
641 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 
547 aa  125  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  31.25 
 
 
525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  32.22 
 
 
644 aa  122  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  33.33 
 
 
680 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
642 aa  120  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
667 aa  120  9e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  32.1 
 
 
480 aa  120  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  32.17 
 
 
714 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  30.2 
 
 
560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  32.21 
 
 
464 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  29.63 
 
 
638 aa  118  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  32.64 
 
 
672 aa  117  6.9999999999999995e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  33.61 
 
 
629 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  32 
 
 
667 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 
554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  32.64 
 
 
680 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  31.74 
 
 
688 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3837  flagellar hook-associated protein FlgK  32.23 
 
 
691 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  30.72 
 
 
456 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  32.41 
 
 
463 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
553 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
553 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
553 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.87 
 
 
683 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
553 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 
553 aa  114  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 
489 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  31.33 
 
 
695 aa  114  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
631 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0665  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 
858 aa  113  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  31.4 
 
 
660 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  32.14 
 
 
486 aa  113  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  29.48 
 
 
471 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.51 
 
 
649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  28.98 
 
 
920 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  35.36 
 
 
570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  32.16 
 
 
642 aa  112  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1233  flagellar hook-associated protein FlgK  28.1 
 
 
649 aa  111  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.8 
 
 
568 aa  111  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  29.46 
 
 
637 aa  110  7.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
643 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
643 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  29.6 
 
 
531 aa  109  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
665 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  31.78 
 
 
643 aa  109  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0560  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 
658 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
659 aa  108  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  29.22 
 
 
539 aa  108  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 
665 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  31.33 
 
 
458 aa  107  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  29.11 
 
 
683 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  30.69 
 
 
682 aa  107  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  29.58 
 
 
588 aa  107  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 
541 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  30.33 
 
 
657 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0181  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 
627 aa  106  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.48 
 
 
681 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.96 
 
 
583 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  32.78 
 
 
480 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  29.51 
 
 
657 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  30.99 
 
 
588 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>