173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5250 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 486 aa  947    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  91.56 
 
 		 486 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  63.87 
 
 		 495 aa  588  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  64.27 
 
 		 495 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  50.82 
 
 		 484 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  50.1 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  42.3 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  44.08 
 
 		 487 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  42.09 
 
 		 484 aa  340  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  41.65 
 
 		 493 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  40.25 
 
 		 464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  38.57 
 
 		 490 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 		 489 aa  296  8e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  39.06 
 
 		 483 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  39.01 
 
 		 487 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  39.26 
 
 		 487 aa  280  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  38.78 
 
 		 485 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  41.52 
 
 		 496 aa  277  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  32.58 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  33.53 
 
 		 485 aa  173  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  31.62 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  31.15 
 
 		 481 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  29.62 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  30.89 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  28.83 
 
 		 486 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.69 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  31.17 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  27.67 
 
 		 727 aa  108  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.95 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 		 632 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  30.12 
 
 		 632 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 503 aa  97.4  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.94 
 
 		 626 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.87 
 
 		 623 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  30.69 
 
 		 588 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 623 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  26.89 
 
 		 623 aa  90.1  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  31.18 
 
 		 585 aa  87.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  31.01 
 
 		 587 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.08 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  27.48 
 
 		 632 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  30.48 
 
 		 618 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  23.82 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  22.86 
 
 		 858 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.84 
 
 		 477 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  22.86 
 
 		 858 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.59 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  25.47 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 		 683 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  24.8 
 
 		 485 aa  76.6  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 		 713 aa  76.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.38 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  26.72 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  22.88 
 
 		 846 aa  73.9  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.18 
 
 		 847 aa  73.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  26.39 
 
 		 682 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  22.79 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  22.96 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  25.37 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.45 
 
 		 458 aa  72  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 		 627 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  26.56 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  24.17 
 
 		 704 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2841  flagellar hook-associated protein FlgK  26.85 
 
 		 681 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.673988  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  23.54 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  23.14 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.36 
 
 		 588 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  21.07 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  24.48 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  25.97 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.87 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  24.89 
 
 		 690 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.99 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  24.93 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  26.34 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  24.42 
 
 		 623 aa  63.5  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  32.51 
 
 		 1363 aa  63.5  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  22.4 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  32.51 
 
 		 1363 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  29.81 
 
 		 680 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.32 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  23.09 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  24.86 
 
 		 560 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 645 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  23.37 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  28.23 
 
 		 1365 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 660 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  20.79 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  27.79 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  21.86 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 683 aa  57.4  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  24.91 
 
 		 640 aa  57  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1628  flagellar hook-associated protein FlgK  54.9 
 
 		 629 aa  57  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.770281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  19.54 
 
 		 525 aa  56.6  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  25.68 
 
 		 642 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>