242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4454 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 623 aa  1237    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  76.57 
 
 		 623 aa  966    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  66.83 
 
 		 626 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  75.28 
 
 		 623 aa  940    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  52.32 
 
 		 619 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  52.79 
 
 		 622 aa  600  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  51.05 
 
 		 611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  38.34 
 
 		 613 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  39.12 
 
 		 632 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  38.97 
 
 		 632 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  37.56 
 
 		 632 aa  353  7e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  38.12 
 
 		 623 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  38.4 
 
 		 618 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  36.76 
 
 		 623 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  37.3 
 
 		 627 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  33.44 
 
 		 599 aa  227  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  31.29 
 
 		 588 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.88 
 
 		 588 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  28.88 
 
 		 727 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  29.55 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  35.12 
 
 		 585 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 		 487 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.43 
 
 		 647 aa  117  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  32.21 
 
 		 485 aa  117  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.96 
 
 		 637 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  29.7 
 
 		 631 aa  110  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  28.88 
 
 		 484 aa  110  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  29.18 
 
 		 696 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 486 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  27.66 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  30.28 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  25.87 
 
 		 644 aa  106  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  30.21 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  24.96 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  24.25 
 
 		 847 aa  106  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  25.79 
 
 		 641 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 481 aa  103  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.46 
 
 		 920 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 481 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  28.22 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  23.3 
 
 		 846 aa  101  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  26.62 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 682 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  31.67 
 
 		 683 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  28.45 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 818 aa  99.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0396  flagellar hook-associated protein FlgK  22.6 
 
 		 609 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0306  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 		 613 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 		 713 aa  99  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 554 aa  97.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  30.84 
 
 		 495 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  27.38 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  27.74 
 
 		 487 aa  97.4  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  29.43 
 
 		 457 aa  97.4  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 531 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  30.42 
 
 		 457 aa  97.1  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.24 
 
 		 858 aa  95.9  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.24 
 
 		 858 aa  95.9  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  23.83 
 
 		 641 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2915  flagellar hook-associated protein FlgK  30.92 
 
 		 660 aa  94.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  28.93 
 
 		 690 aa  94.7  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  28.52 
 
 		 486 aa  94  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  24.7 
 
 		 640 aa  93.6  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 482 aa  93.6  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  29.24 
 
 		 715 aa  93.6  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  30.06 
 
 		 495 aa  92.8  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  25.51 
 
 		 688 aa  92  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 537 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 546 aa  92  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1613  flagellar hook-associated protein FlgK  20.9 
 
 		 637 aa  91.7  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000204233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3031  flagellar hook-associated protein FlgK  28.76 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.16 
 
 		 484 aa  91.3  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  26.65 
 
 		 653 aa  91.3  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0192  flagellar hook-associated protein-like protein  22 
 
 		 838 aa  90.9  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  28.53 
 
 		 641 aa  90.9  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  30.7 
 
 		 489 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  28.48 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  28.38 
 
 		 583 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  90.1  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  25.62 
 
 		 541 aa  89.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  24.54 
 
 		 547 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  24.54 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.41 
 
 		 641 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.493477  normal  0.0693976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  24.69 
 
 		 525 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  24.54 
 
 		 547 aa  89  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.42 
 
 		 623 aa  87.8  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  26.35 
 
 		 657 aa  87.4  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 		 588 aa  87.8  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 704 aa  87.4  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  25.46 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>