233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0765 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 484 aa  971    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  50.82 
 
 		 486 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  51.43 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  48.28 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  48.89 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  45.88 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  45.55 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  37.63 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  37.42 
 
 		 484 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  37.58 
 
 		 490 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  36.38 
 
 		 464 aa  309  9e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  38.6 
 
 		 483 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  38.19 
 
 		 489 aa  289  6e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  34.36 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  38.14 
 
 		 487 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  37.94 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  36.69 
 
 		 496 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  35.26 
 
 		 485 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  32.43 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  28.01 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 487 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 482 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 632 aa  123  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  29.41 
 
 		 632 aa  123  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  27.2 
 
 		 476 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  28.27 
 
 		 632 aa  115  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  24.39 
 
 		 481 aa  114  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  27.77 
 
 		 588 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  31.07 
 
 		 588 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  27.25 
 
 		 626 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  25.34 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  25.82 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  27.64 
 
 		 623 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.41 
 
 		 611 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.69 
 
 		 623 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  23.9 
 
 		 452 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 613 aa  96.3  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  28.04 
 
 		 618 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 623 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  25.16 
 
 		 623 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.36 
 
 		 622 aa  89.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 		 627 aa  89  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  26.61 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1344  flagellar hook-associated protein  24.95 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0451355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.55 
 
 		 464 aa  86.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  25.66 
 
 		 503 aa  86.7  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  27.33 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 		 587 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 		 704 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.15 
 
 		 478 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.4 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  23.67 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  23.74 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 		 623 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  27.23 
 
 		 683 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  30.17 
 
 		 585 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.94 
 
 		 640 aa  79.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  24.5 
 
 		 727 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 714 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  28.19 
 
 		 667 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.76 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  21.7 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  27.96 
 
 		 683 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3034  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  21.73 
 
 		 858 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2401  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 		 715 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3015  flagellar hook-associated protein FlgK  28.91 
 
 		 643 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0316053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  21.73 
 
 		 858 aa  75.1  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  31.68 
 
 		 665 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.68 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  30.35 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  23.61 
 
 		 818 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 713 aa  73.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  25.53 
 
 		 682 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  24.67 
 
 		 631 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2352  flagellar hook-associated protein FlgK  22.77 
 
 		 623 aa  72.8  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.136534  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  28.81 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  22.42 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  22.55 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  21.41 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  25.46 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  23.79 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3010  flagellar hook-associated protein FlgK  28.24 
 
 		 659 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  28.9 
 
 		 642 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0013  flagellar hook-associated protein FlgK  21.15 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  25.11 
 
 		 653 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  26.81 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  24.71 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  27.31 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4430  flagellar hook-associated protein FlgK  23.35 
 
 		 642 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>