256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1007 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 704 aa  1394    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  38.46 
 
 		 713 aa  432  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  26.43 
 
 		 727 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  28.79 
 
 		 588 aa  129  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  29.05 
 
 		 585 aa  122  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  26.75 
 
 		 588 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  28.07 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2938  flagellar hook-associated protein FlgK  25.2 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1354  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2588  flagellar hook-associated protein FlgK  25.1 
 
 		 641 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  26.69 
 
 		 626 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  28.16 
 
 		 638 aa  101  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  28.97 
 
 		 618 aa  100  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  23.73 
 
 		 858 aa  96.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  23.73 
 
 		 858 aa  97.1  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  26.22 
 
 		 613 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1606  flagellar hook-associated protein FlgK  25.84 
 
 		 637 aa  94  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0566107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 452 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  27.64 
 
 		 623 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  24.66 
 
 		 644 aa  91.3  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1349  flagellar hook-associated protein FlgK  26.17 
 
 		 640 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2309  flagellar hook-associated protein  27.64 
 
 		 638 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.133958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1651  flagellar hook-associated protein FlgK  23.1 
 
 		 847 aa  88.6  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  29.47 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  26.59 
 
 		 490 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1312  flagellar hook-associated protein  26.63 
 
 		 639 aa  88.2  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  26.33 
 
 		 623 aa  87.4  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0328  flagellar hook-associated protein FlgK  21.47 
 
 		 846 aa  86.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  24.75 
 
 		 454 aa  86.7  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  24.94 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2244  flagellar hook-associated protein FlgK  24.73 
 
 		 489 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1425  flagellar hook-associated protein FlgK  27.82 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  24.3 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.97 
 
 		 484 aa  84.3  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.84 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  26.97 
 
 		 457 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  26.13 
 
 		 623 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1268  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  26.47 
 
 		 622 aa  81.6  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0095  flagellar hook-associated protein FlgK  26.38 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1170  flagellar hook-associated protein FlgK  29.27 
 
 		 642 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.793737  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1338  flagellar hook-associated protein FlgK  26 
 
 		 641 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  25.39 
 
 		 477 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 		 632 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  26.69 
 
 		 452 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 685 aa  80.5  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 487 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  24.17 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  26.28 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  28.63 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  24.15 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.96 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 		 495 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  26.32 
 
 		 548 aa  77  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.94 
 
 		 623 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239.3  flagellar hook-associated protein  26.75 
 
 		 386 aa  77  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  26.43 
 
 		 695 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  27.55 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  25.25 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  27.27 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0248  flagellar hook-associated protein FlgK  25.56 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  22.38 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  26.07 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  24.9 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  23.36 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  25.63 
 
 		 640 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  24.16 
 
 		 485 aa  73.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  22.92 
 
 		 696 aa  73.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2403  flagellar hook-associated protein FlgK  26.16 
 
 		 697 aa  73.6  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  24.85 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  22.67 
 
 		 480 aa  72.8  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  23.1 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 546 aa  72.8  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  26.78 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.1 
 
 		 588 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  24.13 
 
 		 653 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  26.88 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  26.13 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1619  flagellar hook-associated protein FlgK  27.24 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  25.37 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  24.17 
 
 		 486 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 682 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  25.74 
 
 		 637 aa  69.7  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>