233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1262 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1262  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 450 aa  883    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.237896  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2916  flagellar hook-associated protein  39.24 
 
 		 441 aa  264  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.53 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.04 
 
 		 477 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.06 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  25.58 
 
 		 465 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.95 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  25.56 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 486 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 		 546 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  25.69 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 676 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 637 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  29.06 
 
 		 642 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  27.33 
 
 		 647 aa  95.5  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5634  flagellar hook-associated protein FlgK  27.39 
 
 		 631 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3743  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 631 aa  94.4  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0832  flagellar hook-associated protein FlgK  25.85 
 
 		 463 aa  94  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  26.79 
 
 		 685 aa  93.2  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  24.66 
 
 		 459 aa  93.2  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  27.51 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  25.83 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  27.51 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  27.22 
 
 		 547 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  27.51 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 549 aa  91.3  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3755  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1465  hypothetical protein  24.93 
 
 		 630 aa  88.2  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  22.96 
 
 		 480 aa  87  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2239  flagellar hook-associated protein FlgK  25.31 
 
 		 464 aa  86.7  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0074  FlgK flagellar hook-associated protein 1  30.12 
 
 		 1363 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  27.46 
 
 		 553 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1710  flagellar hook-associated protein FlgK  30.09 
 
 		 1363 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.447823  normal  0.0702953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1534  flagellar hook-associated protein FlgK  29.78 
 
 		 551 aa  86.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  26.16 
 
 		 541 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  23.99 
 
 		 454 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17140  flagellar hook-associated protein FlgK  23.44 
 
 		 471 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  22.34 
 
 		 458 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3839  flagellar hook-associated protein FlgK  26.02 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0049763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31330  flagellar hook-associated protein FlgK  24.63 
 
 		 475 aa  84.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0682409 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  28.39 
 
 		 645 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2041  flagellar hook-associated protein FlgK  24.73 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1111  flagellar hook-associated protein FlgK  25.06 
 
 		 688 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0676298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0215  flagellar hook-associated protein FlgK  23.11 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3471  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 686 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.230935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  22.34 
 
 		 458 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4680  flagellar hook-associated protein FlgK  24.19 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296928 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  27.98 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1663  flagellar hook-associated protein FlgK  30.35 
 
 		 1365 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  23.35 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 683 aa  80.9  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  25.79 
 
 		 657 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0602  flagellar hook-associated protein FlgK  26.93 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3574  flagellar hook-associated protein FlgK  24.55 
 
 		 658 aa  80.1  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1944  flagellar hook-associated protein FlgK  28.02 
 
 		 686 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0163464  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  26.51 
 
 		 657 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1969  flagellar hook-associated protein  24.3 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2589  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 568 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  22.93 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  23.39 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1562  flagellar hook-associated protein FlgK  28.06 
 
 		 640 aa  79  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.776714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3228  flagellar hook-associated protein FlgK  22.94 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  23.8 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  24.73 
 
 		 652 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3723  flagellar hook-associated protein  26.18 
 
 		 644 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875784  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2416  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.524278  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0250  flagellar hook-associated protein FlgK  28.77 
 
 		 667 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2314  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4711  flagellar hook-associated protein FlgK  26.18 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.402809  normal  0.0701142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  25.47 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.56 
 
 		 920 aa  74.3  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  26.83 
 
 		 640 aa  74.3  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  24.82 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2925  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.719396 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  27.68 
 
 		 660 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.43 
 
 		 665 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3064  flagellar hook-associated protein  27.19 
 
 		 653 aa  73.2  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116548  normal  0.281485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  23.43 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  23.88 
 
 		 638 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0022  flagellar hook-associated protein FlgK  26.08 
 
 		 443 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3004  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2089  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 714 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0288  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3344  flagellar hook-associated protein FlgK  27.45 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0391  flagellar hook-associated protein FlgK  24.13 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0799381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>