More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0508 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0508  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 207 aa  414  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  51.52 
 
 		 201 aa  198  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  50 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  50.25 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  195  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  51.01 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  49.75 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 211 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0460  isopropylmalate isomerase small subunit  51.5 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  48.73 
 
 		 201 aa  188  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  48.73 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  48.22 
 
 		 201 aa  187  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  49.24 
 
 		 200 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  47.21 
 
 		 201 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 201 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  47.72 
 
 		 201 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  48.48 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  48.22 
 
 		 201 aa  184  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.98 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  48.99 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  47.47 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  46.7 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  51.94 
 
 		 207 aa  181  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2148  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  49.75 
 
 		 207 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0323042  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  48.22 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 215 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 212 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2092  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.98 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0181351  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  45.02 
 
 		 212 aa  167  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.98 
 
 		 215 aa  167  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  45.02 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  42.86 
 
 		 722 aa  166  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1573  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.292006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0372  isopropylmalate isomerase small subunit  46.46 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  45.96 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  45.96 
 
 		 201 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  44.95 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  43.48 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  43.48 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  43.48 
 
 		 216 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0215  isopropylmalate isomerase small subunit  45.18 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.20437 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34270  3-isopropylmalate dehydratase small subunit , LeuD  47.12 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1412  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162707  normal  0.547785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  43.48 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  43.96 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2224  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.97 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724185  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  43.96 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  46.15 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3469  isopropylmalate isomerase small subunit  47.12 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.068645  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  43.75 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3825  isopropylmalate isomerase small subunit  45.31 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  43.96 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  43.66 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  43.66 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.23 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  161  6e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1670  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.13 
 
 		 204 aa  161  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00715412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  45.19 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0766  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 215 aa  161  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  43 
 
 		 215 aa  160  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  42.03 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  43.27 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  42.72 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  42.51 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09800  3-isopropylmalate dehydratase small subunit LeuD2  42.5 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  41.43 
 
 		 216 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.6 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2131  isopropylmalate isomerase small subunit  46.97 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2163  isopropylmalate isomerase small subunit  43.87 
 
 		 216 aa  158  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.242476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1919  isopropylmalate isomerase small subunit  41.83 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  47.49 
 
 		 197 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  41.06 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5021  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.43 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  42.03 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2315  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  47.24 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.566047  normal  0.0819697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3798  isopropylmalate isomerase small subunit  44.74 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3610  isopropylmalate isomerase small subunit  44.21 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.607492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3069  isopropylmalate isomerase small subunit  43.33 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1446  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  42.38 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00452839  normal  0.703119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>