More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0460 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0460  isopropylmalate isomerase small subunit  100 
 
 		 206 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0508  isopropylmalate isomerase small subunit  51.5 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1190  isopropylmalate isomerase small subunit  48.28 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0216  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.81 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.247072  normal  0.136168 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1564  isopropylmalate isomerase small subunit  45.02 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126411  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  46.73 
 
 		 722 aa  170  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3898  isopropylmalate isomerase small subunit  45.59 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.106034  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0234  isopropylmalate isomerase small subunit  45.1 
 
 		 201 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3591  isopropylmalate isomerase small subunit  45.59 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3269  isopropylmalate isomerase small subunit  46.08 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2522  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.68534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2452  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.45 
 
 		 215 aa  167  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.162518  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4222  isopropylmalate isomerase small subunit  45.59 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0159  isopropylmalate isomerase small subunit  43.84 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.949563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0351  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3028  isopropylmalate isomerase small subunit  45.1 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295047 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0498  isopropylmalate isomerase small subunit  44.61 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1229  isopropylmalate isomerase small subunit  45.97 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal  0.103885 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1147  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.31 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108201 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0883  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0083  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.384389  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2791  isopropylmalate isomerase small subunit  46.08 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0862  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3232  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0869271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1718  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.79 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2585  isopropylmalate isomerase small subunit  46.19 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2521  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1222  isopropylmalate isomerase small subunit  46.45 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.489719  normal  0.012692 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0230  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0827  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 211 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1676  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  46.45 
 
 		 215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1794  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 216 aa  164  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1989  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.108393  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0342  isopropylmalate isomerase small subunit  44.12 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4358  isopropylmalate isomerase small subunit  43.14 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2144  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 216 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.536498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0963  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1820  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.647684 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1246  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.5 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4628  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1424  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.32 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0796  isopropylmalate isomerase small subunit  42.18 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.030547  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3609  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3577  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.613877 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4416  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4326  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.59 
 
 		 210 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3951  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1921  isopropylmalate isomerase small subunit  44.55 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.691189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1541  isopropylmalate isomerase small subunit  43.66 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.466229  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3281  isopropylmalate isomerase small subunit  47.8 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.186191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3846  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.817461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3342  isopropylmalate isomerase small subunit  44.5 
 
 		 216 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1727  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0776  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0211151  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2132  isopropylmalate isomerase small subunit  44.02 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0198572 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1642  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.865269  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0673  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000646407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2314  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0123  isopropylmalate isomerase small subunit  45.81 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2888  isopropylmalate isomerase small subunit  44.76 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0522  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2452  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1851  isopropylmalate isomerase small subunit  43.54 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.30576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1048  isopropylmalate isomerase small subunit  45.24 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1484  isopropylmalate isomerase small subunit  43.66 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1342  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  45.28 
 
 		 216 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.331592  normal  0.464834 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1704  isopropylmalate isomerase small subunit  43.6 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.045793  hitchhiker  0.00210823 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0041  isopropylmalate isomerase small subunit  47.06 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6848  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0246289  normal  0.577423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3297  isopropylmalate isomerase small subunit  43.63 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1890  isopropylmalate isomerase small subunit  44.08 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1811  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  41.4 
 
 		 240 aa  158  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.382373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1780  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  43.4 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972609  hitchhiker  0.00157972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3773  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1185  isopropylmalate isomerase small subunit  43.35 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.840345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0040  isopropylmalate isomerase small subunit  46.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2064  isopropylmalate isomerase small subunit  42.11 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.851734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1986  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 214 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.373676  hitchhiker  0.00883462 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  44.83 
 
 		 762 aa  157  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2722  isopropylmalate isomerase small subunit  45.28 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0158135  normal  0.102803 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4368  isopropylmalate isomerase small subunit  44.29 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23760  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177244 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2013  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0256303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3040  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  155  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2509  isopropylmalate isomerase small subunit  41.87 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1517  isopropylmalate isomerase small subunit  44.34 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0857683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0423  3-isopropylmalate dehydratase small subunit  39.9 
 
 		 194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0497347 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  43.19 
 
 		 772 aa  155  6e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2174  3-isopropylmalate dehydratase, small subunit  44.81 
 
 		 213 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.478942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1421  isopropylmalate isomerase small subunit  43.81 
 
 		 216 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02612  isopropylmalate isomerase small subunit  44.81 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2085  isopropylmalate isomerase small subunit  43.19 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1055  isopropylmalate isomerase small subunit  44.13 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.206266 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5237  isopropylmalate isomerase small subunit  44.08 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0296  isopropylmalate isomerase small subunit  44.88 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0340  isopropylmalate isomerase small subunit  44.88 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1013  isopropylmalate isomerase small subunit  43.4 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1549  isopropylmalate isomerase small subunit  44.34 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1935  isopropylmalate isomerase small subunit  42.92 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.217033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2312  isopropylmalate isomerase small subunit  42.58 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.845153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>