119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1376 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  393  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  41.03 
 
 		 229 aa  148  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  36.41 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  34.13 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.83 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  33.16 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  37.43 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.62 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.62 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.62 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  32.11 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.08 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.09 
 
 		 185 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  34.97 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.62 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.55 
 
 		 185 aa  101  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.09 
 
 		 183 aa  101  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  33.86 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  32.43 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  32.9 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  32.43 
 
 		 193 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  32.94 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.41 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  30.51 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  30.11 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  29.8 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  29.8 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  30.91 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.03 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  29.14 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  28.81 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  30.32 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.05 
 
 		 196 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  28.48 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  29.14 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  28.14 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  28.76 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.97 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.32 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.59 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  25.95 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.67 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  27.27 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  29.09 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.7 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  26.7 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  25.9 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  27.84 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  26.11 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.14 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  25.94 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.02 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  25.24 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.24 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.34 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  24.58 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.24 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  24.34 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25.98 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  35.71 
 
 		 111 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.15 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  25 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.51 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.02 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  31.78 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  33.73 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  29.63 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.71 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.78 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.36 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  28.16 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  28.15 
 
 		 197 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  34.94 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.27 
 
 		 227 aa  47.8  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  25.14 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  30.84 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  25.29 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  26.9 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  29.67 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.69 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  39.24 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.56 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  26.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  37.93 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  35.53 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.4 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.38 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>