63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0432 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  100 
 
 
191 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  100 
 
 
191 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  98.95 
 
 
191 aa  393  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  98.95 
 
 
191 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  90.05 
 
 
191 aa  367  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  90.58 
 
 
191 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  89.53 
 
 
191 aa  362  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 
191 aa  313  7e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  74.74 
 
 
192 aa  310  1e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 
191 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  73.82 
 
 
192 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  73.16 
 
 
191 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  71.05 
 
 
192 aa  292  2e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  67.54 
 
 
197 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.53 
 
 
193 aa  98.2  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.95 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.61 
 
 
185 aa  95.5  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  31.21 
 
 
183 aa  94.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.61 
 
 
185 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  29.03 
 
 
188 aa  94.4  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  28.57 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  29.63 
 
 
198 aa  85.5  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  30.06 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.06 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.06 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.06 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.51 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.9 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.96 
 
 
196 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.27 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  29.14 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  24.72 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.76 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  23.21 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  24.73 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.82 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  24.62 
 
 
207 aa  51.6  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  28.02 
 
 
229 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  22.81 
 
 
202 aa  51.2  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  24.35 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.94 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  22.28 
 
 
211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  24.86 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.67 
 
 
217 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.22 
 
 
224 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  24.84 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  25.53 
 
 
230 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.35 
 
 
196 aa  44.7  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  23.5 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.73 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.94 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.94 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  20.73 
 
 
211 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  22.53 
 
 
196 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  23.4 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  19.69 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  22.35 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25.52 
 
 
211 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.24 
 
 
211 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  23.24 
 
 
211 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.24 
 
 
211 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>