85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0571 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 191 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4074  ATP-dependent protease La  79.06 
 
 		 191 aa  322  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0432  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 191 aa  313  7e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3882  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 191 aa  313  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0458  peptidase S16 lon domain protein  73.82 
 
 		 191 aa  312  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3538  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 191 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0417  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 191 aa  310  5.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4182  ATP-dependent protease La  74.35 
 
 		 191 aa  310  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0444  ATP-dependent protease La  73.3 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3713  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 191 aa  309  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.563365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0518  ATP-dependent protease La  72.77 
 
 		 191 aa  300  6.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0481  ATP-dependent protease La  70.9 
 
 		 192 aa  295  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  69.47 
 
 		 191 aa  294  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.865724 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3349  ATP-dependent protease La  72.63 
 
 		 192 aa  293  9e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0250547 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0548  ATP-dependent protease La  73.82 
 
 		 197 aa  288  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3558  peptidase S16, lon domain-containing protein  68.06 
 
 		 192 aa  285  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  30.37 
 
 		 193 aa  97.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  28.57 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.89 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.89 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.64 
 
 		 183 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  27.42 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  26.98 
 
 		 198 aa  85.9  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  29.48 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.32 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  28.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.32 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.88 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2781  hypothetical protein  28.98 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.27 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  26.5 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1376  hypothetical protein  30.32 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  26.9 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  23.53 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  24.87 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.2 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.5 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  24.38 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  26.24 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  24.87 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  25 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  24.15 
 
 		 230 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  23.44 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.44 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.44 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  23.92 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.92 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.44 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  23.83 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  25.97 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1475  hypothetical protein  25.76 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0699473  normal  0.900175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  27.41 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  26.56 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  23.62 
 
 		 232 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  26.7 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  23.98 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.74 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.14 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  22.82 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  26.77 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.96 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  21.58 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  23.43 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  23.53 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  21.57 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.54 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  21.62 
 
 		 196 aa  45.1  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.74 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  25.51 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  23.33 
 
 		 197 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  23.4 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  22.87 
 
 		 197 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  21.32 
 
 		 209 aa  41.2  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>