184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0321 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  85.78 
 
 
211 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  85.17 
 
 
210 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  66.35 
 
 
211 aa  294  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  66.35 
 
 
211 aa  292  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  65.88 
 
 
211 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  65.88 
 
 
211 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  65.88 
 
 
211 aa  292  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  66.82 
 
 
210 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  67.3 
 
 
210 aa  289  3e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  64.45 
 
 
211 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  64.45 
 
 
211 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  51.67 
 
 
220 aa  235  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  51.89 
 
 
217 aa  225  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  51.79 
 
 
217 aa  218  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  51.79 
 
 
217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  52.82 
 
 
216 aa  205  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  41.31 
 
 
207 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  42.57 
 
 
210 aa  157  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  41.04 
 
 
209 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.44 
 
 
214 aa  144  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  40.76 
 
 
200 aa  141  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  39.05 
 
 
223 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  34 
 
 
194 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  40 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.92 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.51 
 
 
215 aa  125  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  35.51 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  36.89 
 
 
229 aa  125  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  39 
 
 
222 aa  125  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.13 
 
 
224 aa  123  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  34.6 
 
 
230 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.09 
 
 
234 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.64 
 
 
209 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  35.71 
 
 
194 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  39.44 
 
 
196 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  34.36 
 
 
192 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  34 
 
 
191 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  35.75 
 
 
202 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.68 
 
 
193 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  31.66 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  34.48 
 
 
197 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.59 
 
 
183 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.66 
 
 
197 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  32.52 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.12 
 
 
196 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  43.12 
 
 
197 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  31.19 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  45.19 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.48 
 
 
196 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  31.22 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.77 
 
 
213 aa  77.8  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  46.74 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.3 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.94 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  31.07 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  27.96 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  29.21 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  27.65 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.57 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  26.23 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.68 
 
 
183 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  28.06 
 
 
188 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.27 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.77 
 
 
185 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.23 
 
 
183 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  32.67 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.7 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  32.67 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  27.75 
 
 
183 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  26.92 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.46 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  30.05 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.65 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  31.31 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.64 
 
 
182 aa  62.8  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  41.24 
 
 
221 aa  61.6  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.08 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  30.43 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0571  ATP-dependent protease La  26.5 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  31.41 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  37.07 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  27.94 
 
 
233 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.5 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  37.93 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  28.57 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  30.14 
 
 
216 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3375  hypothetical protein  25.26 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  28.29 
 
 
219 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  38.89 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0505  ATP-dependent protease La  25.37 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.865724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>