171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4814 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4814  ATP-dependent protease La  100 
 
 		 197 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344958  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4689  peptidase S16, lon domain-containing protein  99.49 
 
 		 196 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  95.41 
 
 		 196 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  87.24 
 
 		 196 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  71.43 
 
 		 196 aa  275  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  65.82 
 
 		 196 aa  257  9e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  64.29 
 
 		 196 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  63.92 
 
 		 197 aa  231  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  63.4 
 
 		 197 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  58.03 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  62.69 
 
 		 194 aa  224  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  45.11 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.84 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.74 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  41.94 
 
 		 200 aa  124  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3300  peptidase S16 lon domain protein  39.13 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02586  ATP-dependent protease La (LON) domain subfamily  37.77 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  38.39 
 
 		 230 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.74 
 
 		 191 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  38.16 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  37.91 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  37.88 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  36.9 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.92 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  35.92 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3337  hypothetical protein  34.85 
 
 		 207 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0458166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5247  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.92 
 
 		 224 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.469364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3049  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.51 
 
 		 234 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4127  hypothetical protein  35.32 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  39.55 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  34 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1650  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.84 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0591  peptidase S16 lon domain protein  34.33 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555706  hitchhiker  0.00255975 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  35.96 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  34.5 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.5 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.5 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.31 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3491  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.5 
 
 		 209 aa  91.3  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000806385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.31 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.31 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0525  peptidase S16  32.29 
 
 		 194 aa  89.4  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.198265  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  34.98 
 
 		 210 aa  88.6  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1211  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.84 
 
 		 222 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0186807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  32.12 
 
 		 220 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0284  peptidase S16 lon domain protein  32.81 
 
 		 217 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1331  peptidase S16, lon-like  35.57 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178729  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0321  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.34 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1892  hypothetical protein  37.7 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.32 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0296  peptidase S16, lon-like protein  34.18 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.12 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  38.28 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0257  peptidase S16 lon domain protein  32.29 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  34.47 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  42.99 
 
 		 111 aa  80.9  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03286  hypothetical protein  41.82 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0402  hypothetical protein  30.89 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.72 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1979  peptidase S16 lon domain protein  36.32 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.537677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2345  ATP-dependent protease La domain protein  36.32 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.65 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  41.28 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.37 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  33.66 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.84 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.37 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  30.04 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.45 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.03 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  41.38 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1987  ATP-dependent protease La  33.82 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  39.09 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.96 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  38.39 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  43.82 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  27.46 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  34.93 
 
 		 225 aa  67  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2464  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.13 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  42.39 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2346  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.13 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824022  normal  0.0665218 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  29.95 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.47 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2317  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.62 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  38.54 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.34 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  38.39 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  31.54 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  32.43 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01436  hypothetical protein  37.36 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  39.8 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0994  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.65 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  0.798331 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>