More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1487 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1319  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.1 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.276995 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  36.6 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  32.04 
 
 
218 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  31.12 
 
 
218 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  33.9 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  31.69 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  34.52 
 
 
197 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  31.32 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  38.06 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  41.3 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0737  ATP-dependent protease La domain protein  32.12 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.825638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  41.3 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  42.2 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  43.48 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  33.5 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  31.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  31.58 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.43 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.22 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  37.39 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  34.16 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  30.69 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  32.31 
 
 
203 aa  72  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.43 
 
 
233 aa  72  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  30.89 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2563  ATP-dependent protease La  30.85 
 
 
807 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.574534  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  28.43 
 
 
803 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  31 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  32.16 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  27.32 
 
 
806 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  30.24 
 
 
804 aa  69.7  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 
804 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.16 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  28.02 
 
 
804 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  27.94 
 
 
803 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  26.13 
 
 
810 aa  68.6  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  39.83 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  37.5 
 
 
213 aa  68.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  37.89 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  31.22 
 
 
803 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  26.13 
 
 
810 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  29.08 
 
 
786 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.86 
 
 
183 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  30.46 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  28.78 
 
 
805 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1700  ATP-dependent protease La  27.92 
 
 
867 aa  66.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.311837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  31.05 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  28.78 
 
 
807 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3046  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.04 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  28.78 
 
 
807 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  31.82 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  28.72 
 
 
805 aa  65.5  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  33.16 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.94 
 
 
196 aa  65.5  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
807 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.11 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
808 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  28.29 
 
 
807 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
807 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  28.29 
 
 
807 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  38.71 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.14 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  32.83 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  27.8 
 
 
807 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.81 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  30 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.97 
 
 
183 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
806 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4867  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.38 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.39375  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  29.7 
 
 
805 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0912  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 
796 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  25.97 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3111  ATP-dependent protease La  27.86 
 
 
785 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000302601  hitchhiker  0.00000706703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 
813 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  25.97 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  27.8 
 
 
807 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1033  ATP-dependent protease La  30.24 
 
 
811 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0951111  hitchhiker  0.0000000189689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  26.52 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  31.28 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0874  ATP-dependent protease La  27.04 
 
 
806 aa  62.8  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  30.69 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1249  ATP-dependent protease La  27.41 
 
 
805 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  33.61 
 
 
230 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.59 
 
 
222 aa  62.4  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1639  peptidase S16, lon-like protein  35.14 
 
 
111 aa  62.8  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.194614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  32.07 
 
 
815 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  30.57 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1467  ATP-dependent protease La  26.6 
 
 
785 aa  62  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.635914  normal  0.937024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1543  endopeptidase La  27.36 
 
 
781 aa  62  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000152333  hitchhiker  0.000667603 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2274  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.92 
 
 
183 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  36.84 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  39.5 
 
 
226 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>