More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1793 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 213 aa  423  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5613  peptidase S16 lon domain protein  41.18 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.923025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  33.17 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.65 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.94 
 
 		 213 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  34.27 
 
 		 217 aa  102  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  31.5 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  37.3 
 
 		 220 aa  91.7  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  39.89 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.48 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  36.76 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  35.48 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  36.76 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  35.52 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  36.46 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  38.12 
 
 		 222 aa  88.2  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  36.36 
 
 		 220 aa  88.2  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.05 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.03 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.29 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  36.72 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  30.91 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  40.37 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  36.87 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  40.37 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  40.58 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.35 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  45.45 
 
 		 241 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.15 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  32.02 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  43.81 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  32.65 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  32.78 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  45.61 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.08 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.11 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  40.74 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  34.56 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.44 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.23 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.13 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  29.15 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.21 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  31.82 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0587  peptidase S16, lon domain-containing protein  34 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00769973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0575  peptidase S16, lon-like protein  34 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0565  peptidase S16, lon domain-containing protein  34 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.544319 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  44.35 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.16 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0066  peptidase S16, lon N-terminal  32.8 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.394074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  32.7 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0444  peptidase S16 lon domain protein  34.08 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2421  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.38 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 817 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 819 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  31.31 
 
 		 823 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  41.35 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.41 
 
 		 191 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  42.34 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  32.89 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  32.32 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  43.33 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.19 
 
 		 813 aa  65.5  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1097  hypothetical protein  36.03 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000805098  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  29.49 
 
 		 840 aa  65.5  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  31.63 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  26.42 
 
 		 829 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2321  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.89 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.504487  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  36.97 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  43.01 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 816 aa  64.3  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  29.02 
 
 		 817 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  26.54 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  40.78 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2035  ATP-dependent protease La  35.04 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00326778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  24.14 
 
 		 815 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.36 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3243  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.02 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  30.08 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11940  hypothetical protein  39 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3807  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.66 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3619  peptidase S16, lon-like  38.68 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4864  peptidase S16, lon domain-containing protein  38 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  26.07 
 
 		 804 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  26.07 
 
 		 804 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.27 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.59 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  38.56 
 
 		 231 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 		 816 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.27 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  39.18 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.27 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  43.48 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2596  peptidase S16 lon domain protein  38.21 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  39.81 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002698  hypothetical protein  33.04 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.268731  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  41.67 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0389  ATP-dependent protease La  27.62 
 
 		 810 aa  60.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00469679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  28 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>