More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1864 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  100 
 
 		 219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  70.14 
 
 		 222 aa  316  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  63.51 
 
 		 222 aa  300  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  63.51 
 
 		 222 aa  298  4e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  60.63 
 
 		 221 aa  295  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  65.9 
 
 		 223 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  63.93 
 
 		 225 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  63.76 
 
 		 224 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  63.3 
 
 		 224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  61.26 
 
 		 222 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  61.93 
 
 		 224 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  61.68 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  61.68 
 
 		 222 aa  274  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  61.01 
 
 		 224 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  60.55 
 
 		 224 aa  268  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  58.74 
 
 		 223 aa  254  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  56.4 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  56.4 
 
 		 223 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  47.58 
 
 		 227 aa  218  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  54.46 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  54.21 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  47.34 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.94 
 
 		 231 aa  205  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  51.79 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  55.2 
 
 		 223 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  47.14 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  51.34 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.15 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.21 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  47.14 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  47.14 
 
 		 222 aa  174  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  46.19 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  46.19 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  41.01 
 
 		 220 aa  170  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.86 
 
 		 212 aa  161  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  48.72 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  44.1 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.84 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  42.51 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.11 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  40.21 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  34.81 
 
 		 167 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  30.45 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29.27 
 
 		 828 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  30 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  29.65 
 
 		 792 aa  75.1  0.0000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  30.32 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 835 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 843 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  32.14 
 
 		 835 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  35.58 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  34.62 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  35.58 
 
 		 218 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  37.14 
 
 		 220 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.14 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  35.24 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.24 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  38.46 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.98 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  35.58 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  40.32 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  35.14 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  28.16 
 
 		 817 aa  68.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  28.83 
 
 		 805 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10439  hypothetical protein  29.17 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.292057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  31.97 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  43.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26 
 
 		 812 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  36.36 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  33.89 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  29.91 
 
 		 796 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.27 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.4 
 
 		 833 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.5 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  29.26 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  28.95 
 
 		 808 aa  62  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  29.38 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.89 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  39.64 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  33.33 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  27.41 
 
 		 829 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  25.35 
 
 		 817 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  32.08 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  28.87 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  30.36 
 
 		 800 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.72 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.87 
 
 		 786 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  25 
 
 		 816 aa  58.5  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  28.71 
 
 		 840 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  31.43 
 
 		 780 aa  58.2  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  27.98 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  27.62 
 
 		 846 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  27.72 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  28.33 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  26.64 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  30.77 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  30.63 
 
 		 813 aa  54.3  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>