198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1311 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  53.71 
 
 		 224 aa  245  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0082  peptidase S16, lon-like  54.15 
 
 		 224 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  53.92 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.92 
 
 		 222 aa  241  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  53.3 
 
 		 222 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0269  peptidase S16 lon domain protein  52.4 
 
 		 225 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.713172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.86 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0305  Lon family ATP-dependent protease  51.09 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.257248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  50.66 
 
 		 222 aa  235  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  51.75 
 
 		 223 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.39 
 
 		 221 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  52.31 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  50.66 
 
 		 224 aa  229  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  50.22 
 
 		 224 aa  224  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  47.58 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4098  peptidase S16 lon domain protein  51.66 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3774  peptidase S16 lon domain protein  51.66 
 
 		 223 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.428335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1983  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.89 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0309294  normal  0.090677 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0892  ATP-dependent protease La, putative  52 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4244  ATP-dependent protease LA 2  53.55 
 
 		 224 aa  202  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3285  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.13 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  46.86 
 
 		 214 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0836  putative ATP-dependent protease La  51.11 
 
 		 229 aa  191  5e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3046  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.87 
 
 		 226 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  48.08 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4589  peptidase S16 lon domain-containing protein  50.71 
 
 		 220 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1490  putative ATP-dependent protease La, LON  49.04 
 
 		 222 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0140  peptidase S16, lon domain-containing protein  49.04 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306743  normal  0.448781 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2895  peptidase S16, lon domain-containing protein  48.56 
 
 		 222 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0939041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  43.75 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  45.45 
 
 		 215 aa  168  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3271  peptidase S16, lon-like  49.3 
 
 		 223 aa  167  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.557326  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  42.72 
 
 		 217 aa  162  6e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1097  ATP-dependent protease  39.91 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2253  peptidase S16 lon domain protein  43.13 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.865279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3710  peptidase S16, lon-like  44.78 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  41.15 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.03 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  39.2 
 
 		 209 aa  131  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  36.32 
 
 		 216 aa  125  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0873  ATP-dependent protease La  36.14 
 
 		 167 aa  88.2  9e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4306  peptidase S16, lon-like  31.84 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.270785  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4461  peptidase S16 lon domain protein  31.84 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4442  peptidase S16 lon domain protein  31.34 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  33.09 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  34.71 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4451  peptidase S16 lon domain-containing protein  42.06 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.413543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  33.6 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  26.54 
 
 		 833 aa  68.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  36.07 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  32.46 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  34.71 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  36.07 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  33.06 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  33.04 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  30.09 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  30.24 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  30.37 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  30.37 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  30.3 
 
 		 817 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  29.36 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  33.91 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.82 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  35.34 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  27.83 
 
 		 828 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  26.23 
 
 		 843 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2198  peptidase S16 lon domain protein  36.79 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305968  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  32.46 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 		 835 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  26.27 
 
 		 835 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  33.09 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  28.65 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4979  peptidase S16, lon-like  27.45 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.043652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1099  ATP-dependent protease La  26.52 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000182753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  38.52 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  32.76 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  29.38 
 
 		 191 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0602  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.96 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.607878  hitchhiker  0.0000000000989941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  35.29 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.01 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  27.23 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  29.09 
 
 		 808 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1828  peptidase S16, lon-like  35.19 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  27.88 
 
 		 840 aa  55.5  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08320  Peptidase S16, lon N-terminal  30.6 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  26.83 
 
 		 792 aa  55.1  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  31.9 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09893  ATP-dependent protease  24.76 
 
 		 816 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0361  peptidase S16 lon domain protein  29.57 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.18902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  28.42 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  27.91 
 
 		 780 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  31.03 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  26.32 
 
 		 846 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0607  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.05 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 		 829 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  27.13 
 
 		 812 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  26.73 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  30.39 
 
 		 805 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>