More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1072 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  98.64 
 
 
220 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  71.82 
 
 
220 aa  344  6e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  70.45 
 
 
220 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  71.96 
 
 
218 aa  332  4e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  71.03 
 
 
218 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  70.09 
 
 
218 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  70.28 
 
 
218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  63.81 
 
 
217 aa  292  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  62.38 
 
 
211 aa  283  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  57.35 
 
 
218 aa  248  6e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  55.19 
 
 
213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  54.25 
 
 
216 aa  232  3e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  53.52 
 
 
216 aa  232  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  53.3 
 
 
212 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  53.3 
 
 
212 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  51.89 
 
 
212 aa  225  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  50.93 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  35.82 
 
 
220 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  34.56 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  34.83 
 
 
241 aa  95.1  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.13 
 
 
232 aa  91.7  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  35.48 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.9 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.88 
 
 
222 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  29 
 
 
828 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.2 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.47 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
843 aa  81.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
835 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
835 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  41.3 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  34.48 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.82 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0508  peptidase S16 lon domain protein  31.35 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  33.09 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  38.53 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.02 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  31.62 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  38.6 
 
 
208 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  37.74 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  29.09 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.25 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  42.71 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  29.69 
 
 
800 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  36.11 
 
 
214 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.73 
 
 
233 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 
833 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  29.86 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.12 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  35.24 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  30.4 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  28.06 
 
 
804 aa  68.9  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  40.52 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 
823 aa  69.3  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.79 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  33.64 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0819  ATP-dependent protease La  26.92 
 
 
789 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.07 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2956  peptidase S16 lon domain protein  31.36 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.087431  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  37.89 
 
 
222 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0959  peptidase S16 lon domain protein  31.02 
 
 
206 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.61655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  31.93 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.54 
 
 
228 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.85 
 
 
218 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1149  peptidase S16, lon N-terminal  28.7 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  26.87 
 
 
820 aa  65.9  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  33.5 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2324  peptidase S16 lon domain protein  27.84 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.61107 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  40.78 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.44 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0170  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.36 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  34.44 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  33.33 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0034  ATP-dependent protease La (LON) domain protein  40.74 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.174994  hitchhiker  0.000554508 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  28.28 
 
 
808 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  36.7 
 
 
265 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  25.48 
 
 
799 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  24.62 
 
 
797 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  25.62 
 
 
786 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  39.81 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0737  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.06 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.23 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2856  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.81 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2513  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 
813 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0349  peptidase S16, lon N-terminal  38.61 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  31.82 
 
 
224 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1750  peptidase S16 lon domain protein  34.29 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.588781  hitchhiker  0.0015757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  27.61 
 
 
223 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2992  ATP-dependent protease La  24.64 
 
 
813 aa  63.2  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2635  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.24 
 
 
183 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.963975  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  28.8 
 
 
810 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2596  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.29 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.139162  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2710  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.29 
 
 
183 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586726  normal  0.94876 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>