More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1598 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1598  ATP-dependent protease La (LON) domain  100 
 
 
218 aa  450  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17091  ATP-dependent protease La  90.83 
 
 
218 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16971  ATP-dependent protease La  89.45 
 
 
218 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16861  ATP-dependent protease La  86.7 
 
 
218 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1072  ATP-dependent protease La (LON) domain  70.28 
 
 
220 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.281275  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19471  ATP-dependent protease La  69.81 
 
 
220 aa  318  5e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16291  ATP-dependent protease La  68.4 
 
 
220 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23671  ATP-dependent protease La  67.28 
 
 
220 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0556069 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2024  peptidase S16, lon-like  62.86 
 
 
217 aa  288  4e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835929  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0318  peptidase S16, lon-like  61.06 
 
 
211 aa  276  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0927048  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0882  peptidase S16, lon-like  53.3 
 
 
218 aa  221  9e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0047  peptidase S16 lon domain protein  53.59 
 
 
213 aa  217  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0664  peptidase S16 lon domain-containing protein  51.66 
 
 
216 aa  214  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0795384  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1097  peptidase S16 lon domain protein  51.69 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.629243 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1068  peptidase S16 lon domain protein  51.69 
 
 
212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1285  peptidase S16, lon  50.24 
 
 
216 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00129165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0478  peptidase S16, lon-like  49.52 
 
 
212 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.06422  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0706  peptidase S16 lon domain protein  47.39 
 
 
216 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.383851  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2898  peptidase S16 lon domain protein  33.84 
 
 
220 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000438482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1414  peptidase S16 lon domain protein  33.49 
 
 
213 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3197  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.643868  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3703  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.02 
 
 
213 aa  89  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.597101  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3423  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.38 
 
 
233 aa  89  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  normal  0.0175933 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2321  peptidase S16 lon domain protein  35.11 
 
 
222 aa  87  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10810  peptidase S16, lon domain protein  31.34 
 
 
241 aa  85.5  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5080  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.69 
 
 
224 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.207681  hitchhiker  0.00573263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5731  peptidase S16 lon domain protein  34.48 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3182  peptidase S16 lon domain protein  28.45 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0464244  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1487  peptidase S16, lon-like protein  38.53 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1793  peptidase S16 lon domain protein  40.37 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4663  peptidase S16 lon domain protein  37.61 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112882  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0885  peptidase S16, lon domain-containing protein  31.66 
 
 
232 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465483  hitchhiker  0.0012634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4088  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.74 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.211402 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  26 
 
 
828 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3340  peptidase S16 lon domain protein  29.77 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000299764  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2036  ATP-dependent protease La  30 
 
 
800 aa  78.2  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.326048  normal  0.210205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4463  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.56 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526428 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  25 
 
 
843 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2370  peptidase S16, lon domain-containing protein  38.32 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  25 
 
 
835 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  25 
 
 
835 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1698  ATP-dependent protease La  29.57 
 
 
840 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4129  ATP-dependent protease La  28.37 
 
 
825 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.170203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5732  peptidase S16 lon domain protein  37.72 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0055  peptidase S16, lon-like  37.74 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2169  peptidase S16, lon domain-containing protein  40.57 
 
 
218 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.830411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0267  peptidase S16, lon-like  37.38 
 
 
209 aa  72.4  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2046  peptidase S16 lon domain-containing protein  40.38 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal  0.538359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2666  peptidase S16, lon-like protein  35.85 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0423  peptidase S16, lon-like  32.06 
 
 
214 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  26.26 
 
 
799 aa  70.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1311  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.71 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.28291  hitchhiker  0.00327586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  28.08 
 
 
802 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5189  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  27.41 
 
 
780 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0836  peptidase S16 lon domain-containing protein  31.11 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00827096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3666  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.61 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3243  peptidase S16 lon domain protein  26.18 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2252  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.88 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.255799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2527  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1864  peptidase S16 lon domain protein  35.58 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2954  peptidase S16, lon-like protein  40 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0265  peptidase S16, lon-like  35.09 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85375  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0081  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1509  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3113  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0760  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1432  peptidase S16, lon-like  33.33 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.103336  normal  0.140978 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0576  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0592  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2128  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.96 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2937  ATP-dependent protease La  40.43 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0302  peptidase S16 lon domain protein  30.84 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  26.09 
 
 
816 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0074  peptidase S16  28.8 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0481573 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2807  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.85 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.885555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2754  ATP-dependent protease La  26.49 
 
 
817 aa  66.6  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3194  peptidase S16 lon domain protein  27.24 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0481  ATP-dependent protease La  39.36 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1193  ATP-dependent protease La  24.35 
 
 
833 aa  66.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0455  peptidase S16, lon-like  28.57 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0971742  normal  0.103028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2182  peptidase S16, lon-like  28.85 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0235961  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2796  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.85 
 
 
211 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.549382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2209  peptidase S16 lon domain protein  30.88 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.124882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0519  peptidase S16 lon domain-containing protein  28.37 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5918  ATP-dependent protease La  27.87 
 
 
829 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2427  peptidase S16, lon domain-containing protein  28.8 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.350159  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2009  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.27 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0966504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  25.12 
 
 
823 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  26.24 
 
 
808 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0638  peptidase S16, lon N-terminal  29.03 
 
 
196 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00383335  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1294  endopeptidase La  26.37 
 
 
805 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0346664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1411  peptidase S16 lon domain protein  40.86 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6126  peptidase S16, lon-like  28.37 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0230092  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0295  peptidase S16, lon-like  27.23 
 
 
224 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0350179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2714  peptidase S16 lon domain-containing protein  29.33 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.17765 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
810 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  25.98 
 
 
812 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2793  peptidase S16 lon domain-containing protein  35 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.609971  normal  0.193685 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0906  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
810 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>